DelayedArray subsetting via lapply doesn't work

Đang mở
#97 0 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

Chưa có ai nhận issue này.

Đánh giá

Độ khó
3/5
Thời gian dự kiến
1-2 ngày
Mức phù hợp với người mới
45/100
Loại issue
Lỗi
Độ rõ ràng
Khá rõ ràng
Mức độ hoạt động
Đình trệ
Công nghệ
r
Lĩnh vực
data

Hướng nghiên cứu

Bắt đầu bằng cách chạy bản tái hiện R được cung cấp với DelayedArray 0.19.4 và so sánh thao tác subsetting ma trận thông thường với lapply trên một DelayedArray. Truy vết điểm vào của subsetting và cách xử lý sys.call() được đề cập trong báo cáo; hoàn tất khi lời gọi lapply trả về tập con 5-by-2 được yêu cầu mà không có lỗi ngữ cảnh '...'.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

On DelayedArray 0.19.4:

x <- list(matrix(runif(100), 10, 10))
lapply(x, "[", i=1:5, j=1:2, drop=FALSE)
## [[1]]
##           [,1]       [,2]
## [1,] 0.5664114 0.89343894
## [2,] 0.9693973 0.07918907
## [3,] 0.1310845 0.20746916
## [4,] 0.6174420 0.48100379
## [5,] 0.5324374 0.82014878

library(DelayedArray)
y <- list(DelayedArray(x[[1]]))
lapply(y, "[", i=1:5, j=1:2, drop=FALSE)
## Error in eval(subscript, envir = eframe, enclos = eframe) : 
##   '...' used in an incorrect context

Not 100% sure what's happening here, just that there's some voodoo stuff going on with sys.call().

Ngôn ngữ chính
R
Star
29
Fork
12
Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Hướng dẫn đóng góp

Chưa lập chỉ mục được hướng dẫn đóng góp cho kho mã nguồn này

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của Bioconductor/DelayedArray

Tất cả issue của Bioconductor/DelayedArray

Issue tương tự

Thêm issue về R

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.