scverse / scverse/spatialdata-plot

Feature request: visualizing individual z-planes (2.5D)

Offen
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Vorherrschende Sprache
Python
Sterne
86
Forks
21
Ø Merge
14 Std. 50 Min.
Gemergte PRs (30 T.)
3

Beschreibung

Currently in napari we do not support the visualization of 3D data. While full 3D support is too much of a task for the near future, we could improve better support for 2.5D. I propose the following:

  • Have the possibility of adding a parameter called z-plane to a plotting call. (one parameter z-plane per render_...)
  • Internally when dealing with continuous z coordinates have the capability of binning, so lets say I state z-plane=3, this would bin all z coordinates between 2.5 and 3.49 to 3.

Beitragsleitfaden

Beitragsleitfaden öffnen

Erste Schritte

  1. Lies das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
  2. Schreib ins Issue, dass du es übernimmst — das erspart doppelte Arbeit.
  3. Forke das Repository und arbeite in einem Branch.
  4. Öffne einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.

Rechercherichtung

Beginne mit der Untersuchung der vorhandenen render_...-Plotaufrufe und der Handhabung kontinuierlicher z-Koordinaten. Das Issue ist abgeschlossen, wenn Plotaufrufe einen z-plane-Parameter akzeptieren und kontinuierliche z-Koordinaten in die angeforderte Ebene eingeteilt werden.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.

Bewertung

Tech-Stack
python
Bereich
data-visualization
Issue-Typ
Feature
Schwierigkeit
5/5
Geschätzter Aufwand
Über eine Woche
Aktivitätsstatus
Veraltet
Klarheit
Größtenteils klar
Anfängerfreundlichkeit
30/100

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