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Running mypy on script with pd.pivot_table gets exponentially slower with more columns

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bug performance
Lingua principale
Python
Stelle
20.6k
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3.3k
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Descrizione

Bug Report

When running mypy on a script containing pd.pivot_table, the amount of time for mypy to finish grows exponentially with the number of columns selected and aggregated in the table.

To Reproduce

from string import ascii_letters

import numpy as np
import pandas as pd

df = pd.DataFrame({letter: [1, 2, 3] for letter in ascii_letters[:14]})

df2 = pd.pivot_table(
    df,
    values=["a", "b", "c", "d", "e", "f", "g", "h", "i", "j", "k", "l", "m", "n"],
    columns=["a"],
    aggfunc={
        "a": np.sum,
        "b": np.sum,
        "c": np.sum,
        "d": np.sum,
        "e": np.sum,
        "f": np.sum,
        "g": np.sum,
        "h": np.sum,
        "i": np.sum,
        "j": np.sum,
        "k": np.sum,
        "l": np.sum,
        "m": np.sum,
        "n": np.sum,
    },
)

Expected Behavior

It should finish in <1s, like it does if there are fewer columns

image

Actual Behavior

Takes 200 seconds to run mypy on this script

Your Environment

  • Mypy version used: 1.7.0
  • Mypy command-line flags: None
  • Mypy configuration options from mypy.ini (and other config files): None
  • Python version used: 3.8.15

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Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

Direzione di ricerca

Inizia eseguendo il riproduttore Python fornito con mypy 1.7.0 e confronta il tempo di esecuzione man mano che aumentano le colonne selezionate. Esegui il profiling del percorso di type checking per identificare l’origine della crescita; il lavoro è completato quando il riproduttore termina in meno di un secondo con il set di colonne più grande, senza modificarne il comportamento.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Valutazione

Stack tecnologico
numpy, pandas, python
Ambito
devtools, performance
Tipo di issue
Bug
Difficoltà
4/5
Tempo stimato
3-5 giorni
Stato di attività
Ferma
Chiarezza
Abbastanza chiara
Idoneità per principianti
45/100

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