plotly / plotly/plotly.py

px.imshow requires int for facet_col while px.scatter can be str

Aperta
#3,296 1 commento 0 reazioni 0 assegnatari Vedi su GitHub

Nessuno ha ancora preso questa issue.

bug P3
Lingua principale
Python
Stelle
18.8k
Fork
2.8k
Merge medio
16h 26m
PR unite (30g)
21

Descrizione

px.imshow produces an error if the dimension of a facet plot has strings as their labels instead of integers. I ran across this with xarray, however, I believe it is present regardless of the input data structure. The other px graphs, e.g. px.scatter, do allow strings in the facet dimension, so this seems like a bug with imshow. https://plotly.com/python/facet-plots/ has many plotting examples with strings as the facet_col, e.g. "sex=Female" and "sex=Male" from fig = px.scatter(df, x="total_bill", y="tip", color="smoker", facet_col="sex") and many others from px.histogram, px.choropleth, etc.

Versions in use:
python=3.9.1
plotly=4.14.3

Here is an example of the error.

>>> import numpy as np
>>> import xarray as xr
>>> import plotly.express as px
>>> row = xr.Variable('img_row', range(4))
>>> col = xr.Variable('img_col', range(4))
>>> fd = xr.Variable('facet_dim', 'QA QB'.split())
>>> a = [xr.DataArray(np.random.rand(4,4), coords=[row, col]) for i in range(2)]
>>> da_str = xr.concat(a, "facet_dim")
>>> da_var = xr.concat(a, fd)
>>> da_str
<xarray.DataArray (facet_dim: 2, img_row: 4, img_col: 4)>
array([[[0.17020614, 0.23346368, 0.55878844, 0.58773312],
        [0.80092718, 0.25899341, 0.12681188, 0.77129175],
        [0.85068779, 0.48145364, 0.72109667, 0.51325248],
        [0.2659319 , 0.62613397, 0.09588715, 0.59035821]],

       [[0.32991787, 0.59718269, 0.60165123, 0.63523444],
        [0.11699783, 0.19545503, 0.22478829, 0.56217593],
        [0.59725   , 0.34207063, 0.29841437, 0.30079022],
        [0.21422747, 0.74626584, 0.86025186, 0.61071694]]])
Coordinates:
  * img_row  (img_row) int32 0 1 2 3
  * img_col  (img_col) int32 0 1 2 3
Dimensions without coordinates: facet_dim
>>> da_var
<xarray.DataArray (facet_dim: 2, img_row: 4, img_col: 4)>
array([[[0.17020614, 0.23346368, 0.55878844, 0.58773312],
        [0.80092718, 0.25899341, 0.12681188, 0.77129175],
        [0.85068779, 0.48145364, 0.72109667, 0.51325248],
        [0.2659319 , 0.62613397, 0.09588715, 0.59035821]],

       [[0.32991787, 0.59718269, 0.60165123, 0.63523444],
        [0.11699783, 0.19545503, 0.22478829, 0.56217593],
        [0.59725   , 0.34207063, 0.29841437, 0.30079022],
        [0.21422747, 0.74626584, 0.86025186, 0.61071694]]])
Coordinates:
  * img_row    (img_row) int32 0 1 2 3
  * img_col    (img_col) int32 0 1 2 3
  * facet_dim  (facet_dim) <U2 'QA' 'QB'
>>> fig = px.imshow(da_str, facet_col='facet_dim', aspect='equal')
>>> [d.__class__.__name__ for d in fig.data]
['Heatmap', 'Heatmap']
>>> fig = px.imshow(da_var, facet_col='facet_dim', aspect='equal')
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "C:\Users\<NAME>\Miniconda3\envs\jupyter\lib\site-packages\plotly\express\_imshow.py", line 525, in imshow
    col_labels = ["%s=%d" % (slice_label, i) for i in facet_slices]
  File "C:\Users\<NAME>\Miniconda3\envs\jupyter\lib\site-packages\plotly\express\_imshow.py", line 525, in <listcomp>
    col_labels = ["%s=%d" % (slice_label, i) for i in facet_slices]
TypeError: %d format: a number is required, not numpy.str_

I think the culprit is the different string conversions in play. Can the px.imshow col_labels use a more forgiving conversion?
From File "C:\Users\<NAME>\Miniconda3\envs\jupyter\lib\site-packages\plotly\express\_imshow.py", line 525, in imshow
col_labels = ["%s=%d" % (slice_label, i) for i in facet_slices]
From File "C:\Users\<NAME>\Miniconda3\envs\jupyter\lib\site-packages\plotly\express\_core.py", line 1885, in make_figure
col_labels = [prefix + str(s) for s in sorted_group_values[m.grouper]]

Guida per i contributori

Apri la guida per i contributori

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

Direzione di ricerca

Inizia in plotly/express/_imshow.py alla riga segnalata 525, dove vengono formattate le etichette dei facet, e confrontalo con la gestione delle etichette mostrata in plotly/express/_core.py. Riproduci l’esempio di px.imshow usando facet_dim con valori stringa, quindi verifica che le etichette dei facet stringa non sollevino più TypeError e continuino a produrre i facet della heatmap attesi.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Valutazione

Stack tecnologico
python
Ambito
data-visualization
Tipo di issue
Bug
Difficoltà
2/5
Tempo stimato
1-3 ore
Stato di attività
Ferma
Chiarezza
Specificata chiaramente
Idoneità per principianti
35/100

Ricevi le nuove issue nella tua casella

Un breve riepilogo di issue GitHub adatte ai principianti.