Missing sidechain of target in output

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Valutazione

Difficoltà
4/5
Tempo stimato
3-5 giorni
Idoneità per principianti
25/100
Tipo di issue
Bug
Chiarezza
Da chiarire
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
python
Ambito
bioinformatics, machine-learning

Direzione di ricerca

No file, test, or entry point is named. Start by reproducing the reported RFdiffusion output and inspecting the target representation in the resulting PDB; done means determining whether the missing sidechains are expected and documenting the recommended workflow for visualizing a complete complex.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

Hi community,
I am using RFdiffusion to design a binder for a target protein. After running the process, I've noticed that in the output PDB file, my target protein is only represented by its backbone (the sidechains are missing).

Is this the expected behavior?

What is the recommended workflow to visualize the final complete complex?

Thanks!

Lingua principale
Python
Stelle
3.1k
Fork
644
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Guida per i contributori

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Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
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