Numbers become char in fread/fwrite roundtrip

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Difficoltà
4/5
Tempo stimato
3-5 giorni
Idoneità per principianti
35/100
Tipo di issue
Bug
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
r
Ambito
data

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Start by reproducing the issue's tmp.csv example with fread(), numeric coercion, fwrite(), and a second fread(). Read the fread/fwrite type-detection and roundtrip behavior involved; completion should establish and test the intended handling of large numeric values, including the colClasses override behavior.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

fread

Consider the following tmp.csv:

writeLines("q01
-0.207623873704532
-1.4852856113776
-2432100838991580000
-2.33192914235436
-44.8581139833089", tmp <- tempfile())

There's a big number in it. We'll get a character column from this csv:

library(data.table)

dt <- fread(tmp)
dt
                    q01
                 <char>
1:   -0.207623873704532
2:     -1.4852856113776
3: -2432100838991580000
4:    -2.33192914235436
5:    -44.8581139833089

Coerce the column into numeric:

dt[, q01 := as.numeric(q01)]
dt
             q01
           <num>
1: -2.076239e-01
2: -1.485286e+00
3: -2.432101e+18
4: -2.331929e+00
5: -4.485811e+01

Then fwrite it to another csv and re-fread it:

fwrite(dt, tmp2 <- tempfile())

dt2 <- fread(tmp2)
dt2

We still get character column.

                    q01
                 <char>
1:   -0.207623873704532
2:     -1.4852856113776
3: -2432100838991580000
4:    -2.33192914235436
5:    -44.8581139833089

I'm not sure if it is intended behavior. It makes sense if we want to preserve all information but such behavior could be surprising if user assumes that numbers written by fwrite() could be read into numbers by fread(). In this example, it is not the case. Even if we specify colClasses = "numeric", it won't work either:

> dt2 <- fread(tmp2, colClasses = "numeric")
Warning message:
In fread(tmp2, colClasses = "numeric") :
  Attempt to override column 1 <<q01>> of inherent type 'string' down to 'float64' ignored. Only overrides to a higher type are currently supported. If this was intended, please coerce to the lower type afterwards.

> dt2
                    q01
                 <char>
1:   -0.207623873704532
2:     -1.4852856113776
3: -2432100838991580000
4:    -2.33192914235436
5:    -44.8581139833089
Lingua principale
R
Stelle
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Merge medio
14h 4m
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