v2: Update validator

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Valutazione

Difficoltà
5/5
Tempo stimato
Più di una settimana
Idoneità per principianti
30/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Da chiarire
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
python
Ambito
backend, testing-qa

Direzione di ricerca

The issue identifies validation in petab.v2 but names no files or tests. Start by locating the v2 validator and its validation tests, then separate missing-column checks from the strict-mode and deserialization decisions. Done requires an agreed scope and completion of the selected checklist items without truncated or context-poor errors.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

validation

So far, validation in petab.v2 is too lax and validator errors aren't too pretty and are often truncated.

  • Readable error message
  • include sufficient context in error messages
  • Check for missing columns in files
  • Consider using strict mode for validating files, but be more relaxed when programmatically constructing PEtab objects
  • Decide whether we need to be able to de-serialize (somewhat) incorrect PEtab problems
Lingua principale
Python
Stelle
18
Fork
9
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Guida per i contributori

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Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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