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intermine

60 repository indicizzati · Vedi su GitHub

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A powerful open source data warehouse system

Java · 271 stelle
bluegenes
A friendly next-generation interface for Genomic data discovery powered by InterMine

Clojure · 75 stelle
InterMineR
R package for InterMine

R · 18 stelle
intermine-ws-python-docs
Tutorials for the InterMine Python web client

Jupyter Notebook · 14 stelle
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InterMine GSoC informational mini-site for gsoc mentors and students

HTML · 12 stelle
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Dynamic Result Table Library

CoffeeScript · 10 stelle
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InterMine Generic WebService Client Library

JavaScript · 8 stelle
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InterMine Client library in Python

Python · 8 stelle
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Registry to store and browse all known instances of InterMine. Developed during GSoC 2017 by Leonardo Kuffo

JavaScript · 7 stelle
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Project to develop Neo4j as the backing store for InterMine

Java · 6 stelle
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Documentation for the InterMine project

JavaScript · 6 stelle
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Repo for ideas and community discussions about InterMine-related outreach and communities

5 stelle
intermine-homepage-2017
InterMine's new homepage as of 2017

HTML · 5 stelle
biotestmine
An example InterMine - for demoing and testing

Shell · 5 stelle
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Scaffold generator for BlueGenes tools

JavaScript · 5 stelle
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Docker for InterMine

Shell · 5 stelle
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similarity

Python · 4 stelle
biovalidator
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Java · 4 stelle
bluegenes-ux-ideas
Ideas for improvement in ux-ui

4 stelle
intermine_compose
Repo to handle docker orchestration in the cloud

Python · 4 stelle
40 altri repository si trovano su Vedi su GitHub

Adatte ai principianti Tutto

Aperta Tutte

Registry tests should not depend on live site Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 62/100

intermine/intermine-ws-python#101 · Aperta il 11/1/2026
blugene front-end typography is messy Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

intermine/bluegenes#843 · Aperta il 16/10/2024
Intermine and Python 3.11 Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

intermine/intermine-ws-python#98 · Aperta il 7/8/2023
intermine and Python 3.10 Aperta

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 48/100

intermine/intermine-ws-python#96 · 1 commento · Aperta il 16/5/2023
Problems with list upload Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 42/100

intermine/bluegenes#842 · Aperta il 12/5/2023
Mousemine 500: internal sever error Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

intermine/intermine#2452 · Aperta il 4/4/2023
IndexOutOfBoundsException in legacy webapp region search Aperta

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 45/100

intermine/intermine#2451 · Aperta il 16/3/2023
small import issues. collections.abc Aperta

Difficoltà 3/5 Mezza giornata Idoneità per principianti 35/100

intermine/intermine-ws-python#95 · Aperta il 5/3/2023
Permanent URL points to backing legacy mine, not Bluegenes. Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

intermine/bluegenes#840 · 2 commenti · Aperta il 27/2/2023
InterMine © 2017-2021 should be changed to InterMine © 2017-2023 Aperta

Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 50/100

intermine/intermine#2450 · 1 commento · Aperta il 31/1/2023
Support React 18 createRoot in index.js Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

intermine/bluegenes#839 · 1 commento · Aperta il 7/12/2022
orderBy/sortOrder seem to be ignored (results always ordered by id) Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

intermine/imjs#86 · Aperta il 11/10/2022
Add label for all nodes, not just the selected Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 25/100

intermine/bluegenes-interaction-network#26 · 1 commento · Aperta il 16/9/2022
Viewing interaction tools (various, availability and bugs) Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

intermine/bluegenes#837 · 2 commenti · Aperta il 15/9/2022
Move enrichment panel below query results table Aperta

enhancement Results page UI/UX usertesting

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

intermine/bluegenes#836 · Aperta il 9/9/2022
More custom tracking events Aperta

enhancement

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 30/100

intermine/bluegenes#835 · Aperta il 26/8/2022
New data source derived from BioFileConverter not working Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

intermine/intermine#2442 · 1 commento · Aperta il 19/8/2022
Add config var to remove widgets, enrichment and tools from query results page Aperta

enhancement Results page

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 42/100

intermine/bluegenes#834 · Aperta il 5/8/2022
Use webconfig-model.xml headerconfig for report title Aperta

enhancement InterMine backend Report page

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 30/100

intermine/bluegenes#830 · 4 commenti · Aperta il 30/7/2022
enrichment default should be to gene not allele Aperta

Results page

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 38/100

intermine/bluegenes#826 · 4 commenti · Aperta il 28/6/2022
Better error message for saving a list with an existing name Aperta

im-tables-3

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

intermine/bluegenes#823 · 1 commento · Aperta il 21/6/2022
regions Aperta

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 35/100

intermine/pombemine#70 · 6 commenti · Aperta il 21/6/2022
GO term page does not show annotations Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

intermine/pombemine#69 · 7 commenti · Aperta il 21/6/2022
Server error after removing column Aperta

low priority

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

intermine/pombemine#68 · Aperta il 21/6/2022
Help needed for www.pombase.org/pombemine configuration Aperta

configuration high priority

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

intermine/pombemine#66 · 13 commenti · Aperta il 21/6/2022
Enrichment should be on genes rather than alleles (required for demo) Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

intermine/pombemine#65 · 1 reazione · Aperta il 20/6/2022
Cannot always select from drop down Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

intermine/bluegenes#822 · 1 commento · Aperta il 16/6/2022
Extra column for phenotype annotation file phenotype_annotations.pombase.phaf.gz Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 30/100

intermine/pombemine#64 · Aperta il 16/6/2022
Front page "intermine for all" section Aperta

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 35/100

intermine/bluegenes#821 · Aperta il 14/6/2022
GI viewer working on test link but not on main site/ bug Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

intermine/bluegenes#820 · 6 commenti · Aperta il 12/6/2022
COnfigure contents of gene list Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 42/100

intermine/bluegenes#819 · 1 commento · Aperta il 8/6/2022
Crashes with Error: Can not create edge `da89f8f6-6729-4d16-864c-7979ff73cbfe` with unspecified source Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

intermine/bluegenes-interaction-network#24 · Aperta il 8/6/2022
Sending lists to other mines Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

intermine/bluegenes#815 · 3 commenti · Aperta il 6/6/2022
Links to PomBase Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

intermine/bluegenes#814 · 3 commenti · Aperta il 6/6/2022
conditions currently create separate annotations Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 38/100

intermine/pombemine#62 · 2 commenti · Aperta il 6/6/2022
Allele description "NO VALUE" can be inferred for some columns Aperta

low priority

intermine/pombemine#60 · 7 commenti · 1 assegnatario · Aperta il 31/5/2022
Homolog symbol is not loaded for S. cerevisiae orthlogs Aperta

low priority

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100

intermine/pombemine#59 · 1 commento · Aperta il 30/5/2022
General issues (UniProt protein label) Aperta

configuration data_issue low priority

intermine/pombemine#58 · 1 assegnatario · Aperta il 30/5/2022
Add a WebService URL button in the query builder Aperta

enhancement Query Builder

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 28/100

intermine/bluegenes#803 · Aperta il 30/5/2022
allUsers WS + set admin Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

intermine/intermine#2436 · Aperta il 30/5/2022
Multi-mine data federation Aperta

enhancement

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

intermine/bluegenes#802 · Aperta il 30/5/2022
Make it easier to use custom tools in BG cloud instances Aperta

enhancement Tool API

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 35/100

intermine/bluegenes#801 · Aperta il 27/5/2022
Support setting configurables for Tools Aperta

enhancement Tool API

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 30/100

intermine/bluegenes#800 · Aperta il 27/5/2022
Use alphafold instead of RCSB? Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

intermine/bluegenes-protein-visualizer#27 · Aperta il 27/5/2022
Don't load "comments " from UniProt Aperta

configuration low priority please-test

intermine/pombemine#55 · 6 commenti · 1 assegnatario · Aperta il 23/5/2022
Annotation extensions are not available for phenotypes Aperta

data_issue low priority

intermine/pombemine#54 · 1 commento · 1 assegnatario · Aperta il 23/5/2022
modelling MONDO associations to human (include the entire dataset, not our curated associations) Aperta

data_issue low priority

intermine/pombemine#53 · 4 commenti · 1 assegnatario · Aperta il 23/5/2022
Modelling of annotation extensions Aperta

data_issue high priority model_fix please-test

intermine/pombemine#52 · 10 commenti · 1 assegnatario · Aperta il 23/5/2022
gene network widget for gene list Aperta

bug

intermine/pombemine#45 · 15 commenti · 1 assegnatario · Aperta il 18/5/2022
add a scroll bar to the top of the results table Aperta

enhancement im-tables-3

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

intermine/bluegenes#798 · Aperta il 11/5/2022

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