higlass / higlass/higlass-python

Display PNG preview when notebook is shown statically

未关闭
#49 0 条评论 0 个 reaction 已指派 0 人 在 GitHub 查看
主要语言
Python
星标
66
派生
11
PR 合并指标
30 天内没有已合并 PR

描述

This notebook, for example, has a few HiGlass views but they're not visible when previewed in GitHub: https://github.com/reservoirgenomics/paper-data/blob/master/boyle-et-al-2019/Boyle%20et%20al.%202019.ipynb

We should store a PNG of the higlass dashboard and preview that.

Relevant thread: https://github.com/jupyter-widgets/ipywidgets/issues/2280

A relevant PR: https://github.com/jupyter/nbconvert/pull/901

Docs on the IPython.display object that needs to be updated: once we have image data: https://ipython.readthedocs.io/en/stable/api/generated/IPython.display.html#IPython.display.display

贡献指南

打开贡献指南

调研方向

先查看链接的示例 notebook 和 IPython.display 文档,然后检查相关的 ipywidgets thread 和 nbconvert PR,了解现有的静态输出方案。当 HiGlass dashboard 以 PNG 数据存储,并且在 GitHub 上静态预览 notebook 时可见,即视为完成。

由索引模型根据 Issue 内容生成。

评估

技术栈
jupyter-notebook, python
领域
data-visualization
Issue 类型
功能
难度
4/5
预计耗时
3-5 天
活跃度
停滞
描述清晰度
基本清楚
新手友好度
35/100

把新 issue 发到你的邮箱

精选适合新手参与的 GitHub issue 摘要。