higlass / higlass/higlass-python

Unable to run higlass-python

Ouverte
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Langage dominant
Python
Étoiles
66
Forks
11
Métriques de merge des PR
Aucune PR mergée en 30 j

Description

Happy New Year, Hi-Glass team!

I attempted to run the HiGlass Python package locally in a Conda environment and encountered some issues.

When I tried to execute the test script, [hi-glass.py](https://github.com/user-attachments/files/24413088/hi-glass.py), I didn't receive any error messages, and no views of the .cool files appeared.

Here is the list of packages in my Conda environment:

Image
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Initially, I thought the problem might be related to my settings, so I continued to explore other options. I then tried running the Examples.ipynb file on Google Colab, but I still didn't see any results.

Image

I am wondering how to get the package to work properly. Thank you so much!

Guide de contribution

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Piste de recherche

Commencez par reproduire le rapport avec le script hi-glass.py et le notebook Examples.ipynb joints, en utilisant les détails de l’environnement Conda et les fichiers .cool décrits dans l’issue. Vérifiez si l’une ou l’autre des exécutions produit une vue HiGlass visible ou une quelconque sortie, et documentez les conditions dans lesquelles les vues apparaissent.

Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.

Évaluation

Stack technique
jupyter-notebook, python
Domaine
data-visualization
Type d'issue
Bug
Difficulté
4/5
Temps estimé
3-5 jours
Activité
À l'abandon
Clarté
À clarifier
Accessibilité débutants
25/100

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