Copilot CLI loses todos and edits the wrong plan after forked

Describe the bug

If Copilot is asked to update the plan and the todo list, it will update the old plan in the forked session and reports the todo list being empty.

This is likely a problem not only for the plan mode, but whenever it needs to edit a file in the session folder.

Affected version

1.0.78

Steps to reproduce the behavior

1. Ask the agent to create a plan with todos
2. Fork the session
3. Ask it to update the plan and todos

Expected behavior

The agent should edit the plan file and the todo list under the new session folder. The todo list should be copied over for the new session

Additional context

No response

Reproduisez le problème en créant un plan avec des todos, en forkant la session et en demandant à l’agent de mettre à jour les deux. Suivez la façon dont la session forkée sélectionne son fichier de plan et sa liste de todos dans le nouveau dossier de session, puis vérifiez que la liste de todos est copiée et que les deux fichiers sont mis à jour dans la session forkée plutôt que dans la session d’origine.