[Bugs] In use-cases with multi-repo under the same workspace folder, if we opt-in wo...

**Mood:** 😔
**Category:** Bugs

In use-cases with multi-repo under the same workspace folder, if we opt-in worktree, the default behavior is create worktree per repo that is exhausting task and unproductive.

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| Field | Value |
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| App version | 0.2.34 |
| OS | macOS 26.5.0 |
| Theme | GitHub |
| Path | /chat |
| Tenure | Week 2 |

未指定文件或测试。首先复现一个启用 worktree 可选加入的多仓库工作区，并观察当前按仓库进行创建的行为；然后跟踪工作区设置过程中的 worktree 处理。完成后的行为应符合预期的工作区级行为，而不要求为每个仓库执行一项令人筋疲力尽的 worktree 任务。

由索引模型根据 Issue 内容生成。