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LSF/OpenLava template: Signal SIGINT by default to allow R to catch it gracefully

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feature/resources scheduler/lsf
Lingua principale
R
Stelle
87
Fork
10
Metriche di merge delle PR
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Descrizione

When a job is approaching it's maximum run-time limit, LSF sends a `SIGINT` 10 seconds before sending a `SIGKILL` (abrupt; not capturable).

R code can handle the `SIGINT`, but the 10-second heads up might be a bit tight. To adjust this, we can use LSF options `-wa ` and `-wt `, e.g. `-wa INT -wt 1` will give us a 60-second heads up.

# Idea

Update the default LSF template to signal `SIGINT` 60 seconds in advance. Something like:

```bash
<%
## Signal SIGINT 60 seconds (1 minute) before the run-time limit
if (is.null(resources[["wa"]])) {
resources[["wa"]] <- "INT"
}
if (is.null(resources[["wt"]])) {
resources[["wt"]] <- 1
}
%>
```

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Direzione di ricerca

Inizia individuando il template predefinito di LSF/OpenLava e la gestione delle risorse wa e wt. Verifica che i valori predefiniti richiedano SIGINT 1 minuto prima del limite di esecuzione, mantenendo i valori forniti dall'utente; il lavoro è completato quando la submission generata usa questi valori predefiniti e gli override esistenti continuano a funzionare.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Valutazione

Stack tecnologico
hpc, r
Ambito
distributed-systems
Tipo di issue
Funzionalità
Difficoltà
2/5
Tempo stimato
1-3 ore
Stato di attività
Tranquilla
Chiarezza
Abbastanza chiara
Idoneità per principianti
68/100

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