Improve error handling in Problem.from_yaml - format_version

Ouverte
#217 0 commentaires 0 réactions 0 personnes assignées Voir sur GitHub

Personne n'a encore pris cette issue.

Évaluation

Difficulté
2/5
Temps estimé
1-3 heures
Accessibilité débutants
45/100
Type d'issue
Bug
Clarté
Plutôt claire
Activité
À l'abandon
Stack technique
python
Domaine
data

Piste de recherche

Start at the Problem.from_yaml entry point and reproduce the failure with a YAML file missing format_version. Trace the existing version validation and error handling, then make the missing field produce a proper error instead of KeyError; done means the reported case has a clear error and the relevant checks pass.

Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.

Description

validation

Missing format_version in the yaml file should provide a proper error message instead of just KeyError:

--> 250 if yaml_config[FORMAT_VERSION] not in {"1", 1, "1.0.0", "2.0.0"}:
    251     raise ValueError("Provided PEtab files are of unsupported version "
    252                      f"{yaml_config[FORMAT_VERSION]}. Expected "
    253                      f"{format_version.__format_version__}.")
    254 if yaml_config[FORMAT_VERSION] == "2.0.0":

KeyError: 'format_version'
Langage dominant
Python
Étoiles
18
Forks
9
Aucune PR mergée en 30 j

Guide de contribution

Ouvrir le guide de contribution

Par où commencer

  1. Lisez l'issue en entier, puis le guide de contribution du projet.
  2. Signalez en commentaire que vous la prenez — cela évite que deux personnes fassent le même travail.
  3. Forkez le dépôt et travaillez sur une branche.
  4. Ouvrez une pull request qui référence le numéro de l'issue.

Autres issues de PEtab-dev/libpetab-python

Toutes les issues de PEtab-dev/libpetab-python

Issues similaires

Plus d'issues Python

Recevez les nouvelles issues par e-mail

Un résumé court des issues GitHub adaptées aux débutants.