bfast2 / bfast2/strucchangeRcpp
mefp: Error in root.matrix(crossprod(X)): matrix is not positive semidefinite
- Lingua principale
- R
- Stelle
- 6
- Fork
- 5
- Metriche di merge delle PR
- Nessuna PR unita negli ultimi 30g
Descrizione
I have run into a (rare) case where the root of a matrix cannot be found because it's indefinite. Here's a reprex using the bfast package:
``` r
library(bfast)
BugTS = c(0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, NA, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, NA, NA, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, NA, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, NA, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, NA, 2, 2, 3, 5, NA, NA, 3, 2, 3, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, NA, 0, 1, NA, 0, 1)
BugTS = ts(BugTS, start=2009, frequency = 23)
bfastmonitor(BugTS, start=2016, type = "ME")
#> Error in root.matrix(crossprod(X)): matrix is not positive semidefinite
```
Created on 2020-04-07 by the [reprex package](https://reprex.tidyverse.org) (v0.3.0)
Using @appelmar's C++ code, the same error is rendered as:
```r
Error in .sc_cpp_efp_process_me(X, y, rescale, h) :
sqrtmat_sympd(): transformation failed
```
This fails when `type` is set to `ME`, but it works with any other `mefp` types.
Is there a way to detect that this would happen, and then fall back to some other fluctuation process type instead?
Guida per i contributori
Nessuna guida per i contributori indicizzata per questo repository
Direzione di ricerca
Inizia riproducendo l’esempio fornito di bfastmonitor con type="ME", quindi segui il fallimento da mefp attraverso .sc_cpp_efp_process_me e root.matrix(crossprod(X)). Confronta questo percorso con gli altri tipi di mefp e determina quale comportamento ci si aspetta quando la matrice non è semidefinita positiva. Il lavoro è completo quando il fallimento viene rilevato e il fallback concordato o il comportamento visibile all’utente è coperto da un test di regressione.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Valutazione
- Stack tecnologico
- cpp, r
- Ambito
- data
- Tipo di issue
- Bug
- Difficoltà
- 5/5
- Tempo stimato
- Più di una settimana
- Stato di attività
- Ferma
- Chiarezza
- Abbastanza chiara
- Idoneità per principianti
- 28/100