[Bug]: Intermittent issue: Polyscope agent does not stop after clicking Stop button

### Platform

macOS

### Operating system version

macOs Tahoe | 26.3.1 (a)

### System architecture

ARM64 (M1, M2, etc)

### PolyScope Version

Version 0.19.0 (0.19.0)

### Bug description

Occasionally, agents in Polyscope continue running for several hours and do not stop when the Stop button is clicked. This does not happen consistently but occurs often enough to disrupt normal usage.

It blocks further operations while the agent is running and forces a full restart of Polyscope to stop the agent.

It also appears that the agent is not performing any work in the background, but the running timer continues to increase.

### Steps to reproduce

_No response_

### Relevant log output

```shell

```

Es werden keine Quelldateien, Tests, Schritte zur Reproduktion oder Logs bereitgestellt. Beginne damit, den Stop-button-Fehler in Polyscope 0.19.0 unter macOS Tahoe mit ARM64 zu reproduzieren, und verfolge anschließend den laufenden Zustand und den Timer des agent; abgeschlossen ist die Aufgabe, wenn Stop den agent konsistent beendet, ohne dass ein vollständiger Neustart erforderlich ist.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.