aplbrain / aplbrain/BBQS-EMBER-docs

Incorrect BIDS example

Đang mở
#29 0 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub
Ngôn ngữ chính
Không có dữ liệu ngôn ngữ
Star
0
Fork
2
Chỉ số merge pull request
Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Mô tả

on https://docs.emberarchive.org/user-guide/data-standardization/ has

```
my_dataset/
├── dataset_description.json
├── participants.tsv
├── participants.json
├── sub-01/
│ ├── ses-01/
│ │ ├── ieeg/
│ │ │ ├── sub-01_ses-01_task-rest_ieeg.nwb
│ │ │ ├── sub-01_ses-01_task-rest_ieeg.json
│ │ │ ├── sub-01_ses-01_task-rest_channels.tsv
│ │ │ ├── sub-01_ses-01_task-rest_electrodes.tsv
│ │ │ └── sub-01_ses-01_task-rest_events.tsv
│ │ │
│ │ ├── beh/
│ │ │ ├── sub-01_ses-01_task-rest_beh.tsv
│ │ │ └── sub-01_ses-01_task-rest_beh.json
│ │ │
│ │ ├── video/
│ │ │ ├── sub-01_ses-01_task-rest_video.mp4
│ │ │ └── sub-01_ses-01_task-rest_video.json
│ │ │
│ │ └── audio/
│ │ ├── sub-01_ses-01_task-rest_audio.wav
│ │ └── sub-01_ses-01_task-rest_audio.json
```

which I think flawed on a number of levels
- `beh/` typically is for "behavior only", otherwise all relevant info during experiment like `ieeg` would just go into that folder.
- audio/video folders -- I guess, since that is where the catch here since audio/video would go depending on their "purpose",
the last ones likely to follow [BEP047](https://bids.neuroimaging.io/extensions/beps/bep_047.html) to capture behavior. And that is where it would then go under `beh/` following https://bids-specification--2231.org.readthedocs.build/en/2231/modality-specific-files/behavioral-experiments.html . Note that likely you might just have here `_audiovideo.mp4`. If they are for different devices , likely worth adding `_recording-` to clearly disambiguate "what is different" between those two

Overall, for such an example I would recommend to

- prepare PR against https://github.com/bids-standard/bids-examples/ depicting target scenario (if not there already?! check PRs for BEPs there)
- use bids-validator on it to validate that it is legit. Note that if uses a BEP -- should validate using its schema (in PR for bids-examples can point to which BEP PR to use to validate). If multiple -- that is where we might want to establish and track combination of PRs.

Hướng dẫn đóng góp

Chưa lập chỉ mục được hướng dẫn đóng góp cho kho mã nguồn này

Đánh giá

Issue này chưa được đánh giá.

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.