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analyze
Code for specific analysis computations on processed data (e.g. spectral coherence)

Python · スター 7 個

オープンすべて

オープンの issue を 85 件索引しました

(still updating) New environment: possible import/update bugs オープン

bug

aolabNeuro/analyze#413 · コメント 3 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
preproc overwrite doesn't fully overwrite オープン

bug

aolabNeuro/analyze#417 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
delete old postproc functions オープン

invalid

aolabNeuro/analyze#420 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
hand and cursor kinematics in different coordinate systems オープン

bug high priority invalid preprocessing

aolabNeuro/analyze#421 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
update spectrogram code to be more consistent オープン

enhancement

aolabNeuro/analyze#423 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
target indices assumed to start at zero オープン

bug

aolabNeuro/analyze#424 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
tabulate data makes target locations into a list オープン

invalid

aolabNeuro/analyze#427 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
rotate_spatial_data outputs different dimensions if no rotation is applied オープン

bug

aolabNeuro/analyze#434 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
tabulate_behavior_data should tell you which file went wrong オープン

enhancement

aolabNeuro/analyze#438 · コメント 2 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
documentation for earlier versions of aopy オープン

aolabNeuro/analyze#441 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
channel maps not centered オープン

inconsistency

aolabNeuro/analyze#464 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 · 2026年9月13日に索引
plot sessions by trial enhancement オープン

aolabNeuro/analyze#477 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
tabulate_behavior_data and random target chains オープン

enhancement

aolabNeuro/analyze#479 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
tabulate functions need try/except オープン

inconsistency

aolabNeuro/analyze#488 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
remove get_filenames_in_dir() オープン

inconsistency

aolabNeuro/analyze#489 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
have a way to see which preprocessed files exist オープン

enhancement

aolabNeuro/analyze#490 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
figure saving function オープン

enhancement

aolabNeuro/analyze#495 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
enhance tabulate behavior data オープン

enhancement

aolabNeuro/analyze#496 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Trial segments identified in tabulate function may contain multiple actual trials if pause bug occurred オープン

bug

aolabNeuro/analyze#500 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
tabulate_behavior_data() needs a way to handle data missing ecube オープン

bug

aolabNeuro/analyze#501 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Best way to tabulate data when sync_events and bmi3d_events are different オープン

inconsistency

aolabNeuro/analyze#502 · コメント 2 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
calc_mt_tfr time axis not correct if step size not divisible into sampling rate オープン

aolabNeuro/analyze#510 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
accllr enhancements オープン

bug enhancement

aolabNeuro/analyze#515 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
utils.convert_channels_to_mask stops working if more than 53 channels are inputted オープン

bug

aolabNeuro/analyze#535 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
get_data_segment error message not helpful オープン

documentation

aolabNeuro/analyze#550 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
Error in Docstring オープン

aolabNeuro/analyze#566 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
add feature selection functions オープン

enhancement

aolabNeuro/analyze#623 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
proc_eyetracking docstring is missing an argument オープン

documentation

aolabNeuro/analyze#630 · コメント 0 件 · リアクション 1 件 · 担当者 2 名 · 2026年9月13日に索引
tabulate_behavior_center_out reward column is float64 instead of bool datatype オープン

aolabNeuro/analyze#665 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
events['timestamp'] is nan when data has bmi3d but no ecube data オープン

inconsistency preprocessing

aolabNeuro/analyze#675 · コメント 2 件 · リアクション 0 件 · 担当者 2 名 · 2026年9月13日に索引
get mapping doesn’t take limits into account オープン

aolabNeuro/analyze#686 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
_correct_hand_traj no longer needed オープン

inconsistency

aolabNeuro/analyze#742 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 · 2026年9月13日に索引
multiprocessing not necessary in ECoG analysis example オープン

invalid

aolabNeuro/analyze#744 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 · 2026年9月13日に索引
tablet engagement func counts NaN values as "engaged" オープン

aolabNeuro/analyze#747 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 · 2026年9月13日に索引
Add delay period to center out Tabulate function オープン

aolabNeuro/analyze#753 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 2 名 · 2026年9月13日に索引

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