angelolab / angelolab/ark-analysis
Updating deepcell_visualization files after filtering for too small/too big cells from the cell table
Đang mở
enhancement
- Ngôn ngữ chính
- Jupyter Notebook
- Star
- 108
- Fork
- 31
- Chỉ số merge pull request
- Không có pull request nào được merge trong 30 ngày
Mô tả
After running Mesmer/deep cells, we are usually plotting the cell size from the cell_table csv and excluding cells below/above a certain threshold. Is there an option that we could update the deppcell visualization images after this removal so that the cells we have excluded won't be anymore shown as segmented cells in the image? That would be great if you could implement this in your notebook. Thanks
Hướng dẫn đóng góp
Chưa lập chỉ mục được hướng dẫn đóng góp cho kho mã nguồn này
Đánh giá
Issue này chưa được đánh giá.