aim-rsf / aim-rsf/cprd-data-wrangle

Machine-readable metadata not available

Đang mở
#25 0 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub
help wanted question
Ngôn ngữ chính
Jupyter Notebook
Star
12
Fork
0
Chỉ số merge pull request
Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Mô tả

CPRD's metadata (also known as [data specifications](https://www.cprd.com/sites/default/files/2022-02/CPRD%20Aurum%20Data%20Specification%20v2.7%20%28002%29.pdf)) contain all the info we want for this pipeline but they are in PDF. Some of the steps in the current repo, manually copy and paste the metadata from PDF to CSV (machine-readable format) - this is not ideal as it is prone to error, takes time, and is not too scalable (for example, if there is an update to the metadata).

It would be great to access machine-readable structural metadata, for example like the files hosted on the [HDRUK Gateway](https://healthdatagateway.org/en/dataset/692) however the file only contains 'column name' not 'field name' (and field name is the one that is in the data files), the order of the columns are different in the metadata compared to the real/synthetic data files, and we do not know if it is kept up to date.

Hướng dẫn đóng góp

Mở hướng dẫn đóng góp

Đánh giá

Issue này chưa được đánh giá.

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.