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ImportError from wheel installation

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Python
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36
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Descrizione

Hello - thank you so much for the energy that you are investing in providing a wheel installation for VTK.

I have successfully installed the software, but am running into errors on import.

When installing from conda, I get the following error:

---------------------------------------------------------------------------
ImportError                               Traceback (most recent call last)
/srv/conda/envs/notebook/lib/python3.7/site-packages/vtkmodules/vtkRenderingOpenGL2.py in <module>
      4     # use relative import for installed modules
----> 5     from .vtkRenderingOpenGL2Python import *
      6 except ImportError:

ImportError: libGL.so.1: cannot open shared object file: No such file or directory

During handling of the above exception, another exception occurred:

ModuleNotFoundError                       Traceback (most recent call last)
<ipython-input-1-7c7f66f02cd3> in <module>
----> 1 import vtk

/srv/conda/envs/notebook/lib/python3.7/site-packages/vtk.py in <module>
     30     all_spec = importlib.util.find_spec('vtkmodules.all')
     31     all_m = importlib.util.module_from_spec(all_spec)
---> 32     all_spec.loader.exec_module(all_m)
     33 
     34     # import vtkmodules

/srv/conda/envs/notebook/lib/python3.7/site-packages/vtkmodules/all.py in <module>
     31 from .vtkIOXMLParser import *
     32 from .vtkDomainsChemistry import *
---> 33 from .vtkRenderingOpenGL2 import *
     34 from .vtkDomainsChemistryOpenGL2 import *
     35 from .vtkIOXML import *

/srv/conda/envs/notebook/lib/python3.7/site-packages/vtkmodules/vtkRenderingOpenGL2.py in <module>
      7     # during build and testing, the modules will be elsewhere,
      8     # e.g. in lib directory or Release/Debug config directories
----> 9     from vtkRenderingOpenGL2Python import *

ModuleNotFoundError: No module named 'vtkRenderingOpenGL2Python'

When installing with pip, I instead get the following error:

---------------------------------------------------------------------------
ImportError                               Traceback (most recent call last)
/srv/conda/envs/notebook/lib/python3.7/site-packages/vtk/vtkOpenGLKit.py in <module>
      4     # use relative import for installed modules
----> 5     from .vtkOpenGLKitPython import *
      6 except ImportError:

ImportError: libGL.so.1: cannot open shared object file: No such file or directory

During handling of the above exception, another exception occurred:

ModuleNotFoundError                       Traceback (most recent call last)
<ipython-input-1-7c7f66f02cd3> in <module>
----> 1 import vtk

/srv/conda/envs/notebook/lib/python3.7/site-packages/vtk/__init__.py in <module>
     10 from .vtkRenderingKit import *
     11 from .vtkIOKit import *
---> 12 from .vtkOpenGLKit import *
     13 from .vtkParallelKit import *
     14 from .vtkWrappingKit import *

/srv/conda/envs/notebook/lib/python3.7/site-packages/vtk/vtkOpenGLKit.py in <module>
      7     # during build and testing, the modules will be elsewhere,
      8     # e.g. in lib directory or Release/Debug config directories
----> 9     from vtkOpenGLKitPython import *

ModuleNotFoundError: No module named 'vtkOpenGLKitPython'

Note also that this is happening on a headless system (through a Jupyter notebook, running on a JupyterHub installed on EKS), which may be pertinent information.

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Guida per i contributori

Nessuna guida per i contributori indicizzata per questo repository

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

Direzione di ricerca

Inizia riproducendo import vtk nell’ambiente headless JupyterHub segnalato su EKS, utilizzando sia installazioni conda sia pip. Ispeziona i percorsi di importazione in vtkmodules/vtkRenderingOpenGL2.py e vtk/vtkOpenGLKit.py; il lavoro è completato quando il pacchetto viene importato correttamente nella configurazione headless segnalata, senza incorrere in errori relativi a moduli mancanti.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Valutazione

Stack tecnologico
python
Ambito
computer-graphics
Tipo di issue
Bug
Difficoltà
4/5
Tempo stimato
3-5 giorni
Stato di attività
Ferma
Chiarezza
Da chiarire
Idoneità per principianti
25/100

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