JuliaPy / JuliaPy/PyCall.jl

ImportError: libstdc++.so.6: version `CXXABI_1.3.9' not found

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Langage dominant
Julia
Étoiles
1.5k
Forks
186
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Description

Using PyCall on Julia 1.2 I get the following error on a Linux OS when calling `pyimport("scipy.sparse")`

```

ImportError("/usr/bin/../lib64/libstdc++.so.6: version `CXXABI_1.3.9' not found (required by /home/matros/miniconda3/envs/contfi2/lib/python3.7/site-packages/scipy/sparse/_sparsetools.cpython-37m-x86_64-linux-gnu.so)")
File "/home/matros/miniconda3/envs/contfi2/lib/python3.7/site-packages/scipy/sparse/__init__.py", line 230, in
from .csr import *
File "/home/matros/miniconda3/envs/contfi2/lib/python3.7/site-packages/scipy/sparse/csr.py", line 13, in
from ._sparsetools import (csr_tocsc, csr_tobsr, csr_count_blocks,
```
the PYTHON variable is correctly set to a conda environment where I can import the module `scipy.sparse` without any problem. I tried using `export LD_LIBRARY_PATH=$HOME/miniconda3/envs/contfi2/lib:$LD_LIBRARY_PATH` before calling Julia to no avail.

Guide de contribution

Aucun guide de contribution indexé pour ce dépôt

Piste de recherche

Commencez par reproduire l’échec dans pyimport("scipy.sparse") avec la version indiquée de Julia 1.2, l’environnement conda, le paramètre PYTHON et LD_LIBRARY_PATH. Comparez cela avec l’importation directe de scipy.sparse dans cet environnement ; le travail est considéré comme terminé lorsque vous avez identifié pourquoi la bibliothèque requise CXXABI_1.3.9 n’est pas disponible lors de l’appel via PyCall.

Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.

Évaluation

Stack technique
julia, python
Domaine
tooling
Type d'issue
Bug
Difficulté
4/5
Temps estimé
3-5 jours
Activité
À l'abandon
Clarté
À clarifier
Accessibilité débutants
35/100

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