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Abierto Todos

add test for linear interpolation of rdistmodel calls Abierto

Jhsmit/ColiCoords#18 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
write type of optimization metadata to file Abierto

feature request

Jhsmit/ColiCoords#24 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
metadata support for images Abierto

feature request

Jhsmit/ColiCoords#25 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
make a logfile upon optimization Abierto

Jhsmit/ColiCoords#28 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
write img metadata to cell object when using data_to_cells Abierto

feature request

Jhsmit/ColiCoords#30 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
save cell properties and custom arrays to file Abierto

feature request

Jhsmit/ColiCoords#40 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
Allow 3d STORM Abierto

feature request

Jhsmit/ColiCoords#42 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
A preview of another channel Abierto

Jhsmit/ColiCoords#47 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
paintbrush brush size change / brush size squared Abierto

Jhsmit/ColiCoords#48 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
Add pyqt 4 support Abierto

Jhsmit/ColiCoords#51 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
performance of fluorescence optimizer is slow Abierto

enhancement

Jhsmit/ColiCoords#52 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
support crop cell when cropping shape equal to current shape Abierto

Jhsmit/ColiCoords#56 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
save load synthetic cell data Abierto

Jhsmit/ColiCoords#59 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
add storm / membrane synthesized data methods in SynthCellList Abierto

Jhsmit/ColiCoords#60 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
plot_r_dist in CellListPlot only print once if using storm incompatible method Abierto

Jhsmit/ColiCoords#61 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
CellListPlot wrong y label when plotting storm data Abierto

Jhsmit/ColiCoords#62 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
storm plot method gauss performance Abierto

Jhsmit/ColiCoords#63 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
colorbar / scalebar options for CellPlot imshow / plot_storm Abierto

enhancement

Jhsmit/ColiCoords#65 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
hyperparameter optimization of differential evolution Abierto

Jhsmit/ColiCoords#67 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
implement __str__ for colicoords.Coords Abierto

feature request

Jhsmit/ColiCoords#69 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
Plotting needs major reworking Abierto

enhancement

Jhsmit/ColiCoords#73 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
CellList optimize optionally skip over erros and report Abierto

Jhsmit/ColiCoords#75 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
classical spatial dist for storm data Abierto

Jhsmit/ColiCoords#77 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
add 'limit_l' kwarg for hist_r_dist plotting option Abierto

Jhsmit/ColiCoords#79 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
scipy 1.2.0 differential evolution result is much worse (and takes less time) Abierto

Jhsmit/ColiCoords#80 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
Memory usage of optimize_mp increases over time Abierto

Jhsmit/ColiCoords#81 · 2 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
bounds for Powell minimizing Abierto

Jhsmit/ColiCoords#84 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
test custom minimize functions Abierto

Jhsmit/ColiCoords#85 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
method 'box' vs 'gauss' in CellImageFunction Abierto

Jhsmit/ColiCoords#86 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
importing from colicoords.plot override plotting defaults Abierto

Jhsmit/ColiCoords#87 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
STORM refactor to SMLM Abierto

Jhsmit/ColiCoords#88 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
allow show datapoints for plotting of axial distribution graphs Abierto

Jhsmit/ColiCoords#89 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
STORM axial distribution plotting should give storm reconstruction result Abierto

Jhsmit/ColiCoords#90 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
super resolution reconstruction in multicolor Abierto

Jhsmit/ColiCoords#91 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
generalize crop_cell into indexing function Abierto

Jhsmit/ColiCoords#92 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
parrallel hdf5 reading Abierto

Jhsmit/ColiCoords#94 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
KDE for plotting storm Abierto

Jhsmit/ColiCoords#99 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
Implement radon transform Abierto

feature request

Jhsmit/ColiCoords#100 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
storm rendering with guassian normalization Abierto

Jhsmit/ColiCoords#105 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
implement longitudinal and angular distribution kymographs Abierto

Jhsmit/ColiCoords#106 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
Joining CellLists Abierto

Jhsmit/ColiCoords#111 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
symfit deprecationwarning Abierto

Jhsmit/ColiCoords#113 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
matplotlib deprecationwarning Abierto

Jhsmit/ColiCoords#114 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
Radial distribution errors over occasional cells Abierto

Jhsmit/ColiCoords#122 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
Calculating Fluorescence Intensity at poles Abierto

Jhsmit/ColiCoords#126 · 1 comentario · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 18/9/2026
Missing PyPi description Abierto

Jhsmit/PymageJ#8 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
minimizers take optional guesses Abierto

Jhsmit/slimfit#3 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
modification of parameters Abierto

Jhsmit/slimfit#4 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
shaped bounds Abierto

Jhsmit/slimfit#10 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026
delete numerical model after fitting Abierto

Jhsmit/slimfit#11 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 18/9/2026

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