Profile the code in a standard execution to identify bottlenecks

[Profiling of the code](https://docs.python.org/3/library/profile.html) will be done with the [current examples](https://github.com/SGIModel/MUSE_OS/tree/develop/run/example) to identify bottlenecks in the execution and those parts of the code that could be improved in the future.

The output of completing this issue would be a list of issues identifying those areas that need improvement from the performance perspective.

Beginne mit der im Issue verlinkten Python-Profiling-Dokumentation und den aktuellen Beispielen unter run/example. Profiliere eine Standardausführung anhand dieser Beispiele und überprüfe anschließend die Ausgabe, um Ausführungsengpässe und Codebereiche für künftige Performance-Arbeiten zu identifizieren. Als erledigt gilt die Erstellung einer Liste von Folge-Issues, in denen die verbesserungsbedürftigen Bereiche beschrieben werden.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.