DiamondLightSource/python-murfey

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Client-Server architecture hauling Cryo-EM data around systems

Étoiles: 2
Forks: 1
Issues débutants ouvertes: 0
Issues indexées: 34
Merge moyen: 1 j 10 h
PR mergées (30 j): 19

Langage dominant: Python
Licence: BSD-3-Clause
Dernier push GitHub: 11/9/2026
Dernière indexation: 15/9/2026
Guide de contribution: Aucun guide de contribution
Code de conduite: Aucun code de conduite
Labels débutants: Aucun label débutant indexé

Ouverte Toutes

34 issues indexées à ce jour

Add a time API call to get current server time Ouverte

DiamondLightSource/python-murfey#56 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 15/9/2026
Show pixel size in Angstroms Ouverte

DiamondLightSource/python-murfey#111 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 15/9/2026
Configurable processing and processing parameters Ouverte

DiamondLightSource/python-murfey#151 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 15/9/2026
Add more tests for server side Ouverte

DiamondLightSource/python-murfey#195 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 15/9/2026
Register processing parameters to provide users with more detail Ouverte

DiamondLightSource/python-murfey#199 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 15/9/2026
Add option to disable alertmanager monitoring Ouverte

DiamondLightSource/python-murfey#200 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 15/9/2026
Record dose for each movie as measured during acquisition Ouverte

DiamondLightSource/python-murfey#213 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 15/9/2026
Better handling of ISPyB lookup of session ID failure needed Ouverte

DiamondLightSource/python-murfey#229 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 15/9/2026
Record position tracking data in ISPyB tables Ouverte

position tracking

DiamondLightSource/python-murfey#234 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 15/9/2026
Develop unit tests for API endpoints Ouverte

DiamondLightSource/python-murfey#235 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 15/9/2026
When destinations are explicitly added for existing sources they should be created Ouverte

DiamondLightSource/python-murfey#236 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 15/9/2026
Coordination of different rsync threads Ouverte

DiamondLightSource/python-murfey#251 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 15/9/2026
Murfey for CryoCLEM Ouverte

cryo-clem enhancement

DiamondLightSource/python-murfey#288 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 15/9/2026
Remove the tilt offset parameter for tomography Ouverte

DiamondLightSource/python-murfey#347 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 15/9/2026
Handle instrument server post failures Ouverte

DiamondLightSource/python-murfey#348 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 15/9/2026
Refactor SQL tables, API endpoints, and feedback-callback function into submodules Ouverte

enhancement

DiamondLightSource/python-murfey#375 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 15/9/2026
Murfey server still looks for security configuration file path from environment variable instead of machine configuration Ouverte

bug server

DiamondLightSource/python-murfey#397 · 2 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 15/9/2026
RSync URL for instrument server setup Ouverte

DiamondLightSource/python-murfey#474 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 15/9/2026
Murfey validates ALL MachineConfigs in the MachineConfig file Ouverte

bug server

DiamondLightSource/python-murfey#488 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 15/9/2026
Add MachineConfig key to set whether and how permissions are modified when transferring files via rsync Ouverte

enhancement

DiamondLightSource/python-murfey#489 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 15/9/2026
Finalising all rsyncers through the instrument server seems to cause connection issues with the database Ouverte

bug web ui

DiamondLightSource/python-murfey#530 · 1 commentaire · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 15/9/2026
No logic to handle case where no microscope image is provided for the frontend Ouverte

bug server web ui

DiamondLightSource/python-murfey#551 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 15/9/2026
The "allow_removal" MachineConfig key doesn't work Ouverte

client

DiamondLightSource/python-murfey#562 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 15/9/2026
Cleaner rsync still submits messages to server Ouverte

bug client

DiamondLightSource/python-murfey#580 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 15/9/2026
The cleanup function doesn't fully wipe the database of entries related to that particular session Ouverte

bug server

DiamondLightSource/python-murfey#581 · 1 commentaire · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 15/9/2026
API endpoints in "murfey.server.api.spa" might be vestigial and can be removed Ouverte

DiamondLightSource/python-murfey#596 · 1 commentaire · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 15/9/2026
Spaces in file paths still cause problems Ouverte

DiamondLightSource/python-murfey#619 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 15/9/2026
Add logic to automate XRM data transfer and processing workflow Ouverte

client enhancement server xrm

DiamondLightSource/python-murfey#627 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 15/9/2026
Add analyser and context logic for XRM workflow Ouverte

DiamondLightSource/python-murfey#628 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 15/9/2026
Add database tables to store XRM workflow metadata as needed Ouverte

DiamondLightSource/python-murfey#629 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 15/9/2026
Add server-side endpoints to handle processing of XRM files Ouverte

DiamondLightSource/python-murfey#630 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 15/9/2026
CrYOLO model path caching means changes are not detected during collection Ouverte

DiamondLightSource/python-murfey#646 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 15/9/2026
Rsyncers don't start correctly on reconnect Ouverte

DiamondLightSource/python-murfey#791 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 15/9/2026
Restructure the data collection group tags to use the rsyncer table Ouverte

DiamondLightSource/python-murfey#792 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 15/9/2026

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