DiamondLightSource/python-murfey

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Client-Server architecture hauling Cryo-EM data around systems

Estrellas: 2
Forks: 1
Issues abiertos para principiantes: 0
Issues indexados: 34
Merge medio: 1 d 10 h
PR fusionados (30 d): 19

Lenguaje dominante: Python
Licencia: BSD-3-Clause
Último push a GitHub: 11/9/2026
Última indexación: 15/9/2026
Guía de contribución: Sin guía de contribución
Código de conducta: Sin código de conducta
Etiquetas para principiantes: Sin etiquetas para principiantes indexadas

Abierto Todos

34 issues indexados hasta ahora

Add a time API call to get current server time Abierto

DiamondLightSource/python-murfey#56 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 15/9/2026
Show pixel size in Angstroms Abierto

DiamondLightSource/python-murfey#111 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 15/9/2026
Configurable processing and processing parameters Abierto

DiamondLightSource/python-murfey#151 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 15/9/2026
Add more tests for server side Abierto

DiamondLightSource/python-murfey#195 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 15/9/2026
Register processing parameters to provide users with more detail Abierto

DiamondLightSource/python-murfey#199 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 15/9/2026
Add option to disable alertmanager monitoring Abierto

DiamondLightSource/python-murfey#200 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 15/9/2026
Record dose for each movie as measured during acquisition Abierto

DiamondLightSource/python-murfey#213 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 15/9/2026
Better handling of ISPyB lookup of session ID failure needed Abierto

DiamondLightSource/python-murfey#229 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 15/9/2026
Record position tracking data in ISPyB tables Abierto

position tracking

DiamondLightSource/python-murfey#234 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 15/9/2026
Develop unit tests for API endpoints Abierto

DiamondLightSource/python-murfey#235 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 15/9/2026
When destinations are explicitly added for existing sources they should be created Abierto

DiamondLightSource/python-murfey#236 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 15/9/2026
Coordination of different rsync threads Abierto

DiamondLightSource/python-murfey#251 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 15/9/2026
Murfey for CryoCLEM Abierto

cryo-clem enhancement

DiamondLightSource/python-murfey#288 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 15/9/2026
Remove the tilt offset parameter for tomography Abierto

DiamondLightSource/python-murfey#347 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 15/9/2026
Handle instrument server post failures Abierto

DiamondLightSource/python-murfey#348 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 15/9/2026
Refactor SQL tables, API endpoints, and feedback-callback function into submodules Abierto

enhancement

DiamondLightSource/python-murfey#375 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 15/9/2026
Murfey server still looks for security configuration file path from environment variable instead of machine configuration Abierto

bug server

DiamondLightSource/python-murfey#397 · 2 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 15/9/2026
RSync URL for instrument server setup Abierto

DiamondLightSource/python-murfey#474 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 15/9/2026
Murfey validates ALL MachineConfigs in the MachineConfig file Abierto

bug server

DiamondLightSource/python-murfey#488 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 15/9/2026
Add MachineConfig key to set whether and how permissions are modified when transferring files via rsync Abierto

enhancement

DiamondLightSource/python-murfey#489 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 15/9/2026
Finalising all rsyncers through the instrument server seems to cause connection issues with the database Abierto

bug web ui

DiamondLightSource/python-murfey#530 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 15/9/2026
No logic to handle case where no microscope image is provided for the frontend Abierto

bug server web ui

DiamondLightSource/python-murfey#551 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 15/9/2026
The "allow_removal" MachineConfig key doesn't work Abierto

client

DiamondLightSource/python-murfey#562 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 15/9/2026
Cleaner rsync still submits messages to server Abierto

bug client

DiamondLightSource/python-murfey#580 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 15/9/2026
The cleanup function doesn't fully wipe the database of entries related to that particular session Abierto

bug server

DiamondLightSource/python-murfey#581 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 15/9/2026
API endpoints in "murfey.server.api.spa" might be vestigial and can be removed Abierto

DiamondLightSource/python-murfey#596 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 15/9/2026
Spaces in file paths still cause problems Abierto

DiamondLightSource/python-murfey#619 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 15/9/2026
Add logic to automate XRM data transfer and processing workflow Abierto

client enhancement server xrm

DiamondLightSource/python-murfey#627 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 15/9/2026
Add analyser and context logic for XRM workflow Abierto

DiamondLightSource/python-murfey#628 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 15/9/2026
Add database tables to store XRM workflow metadata as needed Abierto

DiamondLightSource/python-murfey#629 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 15/9/2026
Add server-side endpoints to handle processing of XRM files Abierto

DiamondLightSource/python-murfey#630 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 15/9/2026
CrYOLO model path caching means changes are not detected during collection Abierto

DiamondLightSource/python-murfey#646 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 15/9/2026
Rsyncers don't start correctly on reconnect Abierto

DiamondLightSource/python-murfey#791 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 15/9/2026
Restructure the data collection group tags to use the rsyncer table Abierto

DiamondLightSource/python-murfey#792 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 15/9/2026

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