BlueBrain / BlueBrain/BlueGraph

Use BlueGraph on Connectome Analysis

Offen
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Vorherrschende Sprache
Python
Sterne
34
Forks
5
PR-Merge-Kennzahlen
Keine gemergten PRs in 30 T.

Beschreibung

Hello BlueGraph Team,

I was working on BBP circuits via representing them as graph, analyzing the motifs but couldnt find a way to visualize these dense graphs. Then I came across this platform thanks to Cyrille Favreau. Is there a jira project assigned to this ?

So far i have used networkx and igraph (more scalable as i was told) to analyses. but mostly I store my graph in adjacency matrix format and do operations on scipy.sparse module. I started to use Neo4j but the syntax is a bit annoying. So making a python backend would be very nice and scalable when we integrate it to bluegraph

Here are my projects if i can have a nice UI for the graph:

1. Utilize 5th floor screen, open deck to visualize the graph to do lots of cool stuff
2. Connect it to python scripts we already have.
3. Make novel and visualization-based simulation analyses. See VIZTM-860, and also this cool company's work and demo video https://cambridge-intelligence.com/products/ on static and dynamic analyses of graph data.

Since we have this software and brain is a graph, i say lets use it on it :)

All the best,
Kerem

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Rechercherichtung

Es wird keine Datei, kein Test und kein Einstiegspunkt genannt. Kläre zunächst, ob die Anfrage Graphvisualisierung, Python-Integration, Neo4j-Unterstützung oder Simulationsanalyse betrifft, und ermittle anschließend die relevanten Einstiegspunkte von BlueGraph. Die Anfrage definiert für diesen umfassenden Vorschlag keine testbare Abschlussbedingung.

Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.

Bewertung

Tech-Stack
neo4j, python
Bereich
backend-api-design, data-visualization
Issue-Typ
Feature
Schwierigkeit
5/5
Geschätzter Aufwand
Über eine Woche
Aktivitätsstatus
Veraltet
Klarheit
Muss geklärt werden
Anfängerfreundlichkeit
15/100

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