BergelsonLab/blabpy

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Python package to facilitate lab work

Sterne: 0
Forks: 0
Offene Anfänger-Issues: 0
Indexierte Issues: 30

Vorherrschende Sprache: Python
Lizenz: MIT
Letzter GitHub-Push: 03.8.2026
Zuletzt indexiert: 14.9.2026
Beitragsleitfaden: Beitragsleitfaden
Verhaltenskodex: Kein Verhaltenskodex
Anfänger-Labels: good first issue
PR-Merge-Kennzahlen: Keine gemergten PRs in 30 T.

Offen Alle

Bisher 30 offene Issues indexiert

allow user to ignore missing Seedlings files Offen

BergelsonLab/blabpy#1 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 14.9.2026
write logs to the output directory, not the current one Offen

BergelsonLab/blabpy#2 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 14.9.2026
zero-duration should be dealt with in the cha files, not in the code Offen

BergelsonLab/blabpy#3 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 14.9.2026
unomment timestamp consistency checks Offen

BergelsonLab/blabpy#4 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 14.9.2026
parallelize all seedlings-level pipeline operations Offen

BergelsonLab/blabpy#6 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 14.9.2026
substitute logging for all prints Offen

BergelsonLab/blabpy#7 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 14.9.2026
do not merge with basic level data on NA annotid Offen

bug

BergelsonLab/blabpy#8 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 14.9.2026
remove listened_time._process_regions - not used anywhere Offen

listen time

BergelsonLab/blabpy#10 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 14.9.2026
clean listened_time functions once we are done Offen

listen time

BergelsonLab/blabpy#11 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 14.9.2026
clean up the logic of removing subregions with makeup/extra overlapping Offen

listen time

BergelsonLab/blabpy#12 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 14.9.2026
deal with non-empty folder errors when running make_updated_basic_level_files Offen

enhancement

BergelsonLab/blabpy#13 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 14.9.2026
refactor tests Offen

BergelsonLab/blabpy#14 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 14.9.2026
add io functions for various csv files Offen

BergelsonLab/blabpy#15 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 14.9.2026
use explicit NA for the pho column Offen

BergelsonLab/blabpy#16 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 14.9.2026
path lookup should (?) all check that the path exists Offen

BergelsonLab/blabpy#17 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 14.9.2026
vihi.paths: checking ids should be a decorator Offen

refactor

BergelsonLab/blabpy#18 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 14.9.2026
upload blabpy to a conda channel Offen

BergelsonLab/blabpy#19 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 14.9.2026
add function to easily concatenate dataframe Offen

BergelsonLab/blabpy#20 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 14.9.2026
drop annotation count from blabpy.listen_time.preprocess_region_info Offen

BergelsonLab/blabpy#21 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 14.9.2026
clean up "pipeline" modules Offen

BergelsonLab/blabpy#22 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 14.9.2026
add missing fields to setup.py Offen

BergelsonLab/blabpy#23 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 14.9.2026
add days_to_months function Offen

BergelsonLab/blabpy#24 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
remove caching from seedlings.paths Offen

bug

BergelsonLab/blabpy#25 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 14.9.2026
write a `map_plus` function Offen

BergelsonLab/blabpy#26 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 14.9.2026
pandas helper: where join Offen

BergelsonLab/blabpy#27 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 14.9.2026
avoid printing traceback for console script errors Offen

BergelsonLab/blabpy#29 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 14.9.2026
make git cloning progress bar prettier Offen

good first issue

BergelsonLab/blabpy#31 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
add `vihi annotation update-links` Offen

BergelsonLab/blabpy#32 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 14.9.2026
CHA files function not working Offen

BergelsonLab/blabpy#34 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026
its.py new sub_recording column names Offen

bug

BergelsonLab/blabpy#35 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 14.9.2026

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