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AllenNeuralDynamics
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aind-ephys-pipeline
AIND pipeline for processing extracellular electrophysiology data
Nextflow · 41 estrellas
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aind-data-schema
A library that defines AIND data schema and validates JSON.
Python · 34 estrellas
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openscope-community-predictive-processing
This repository serves as a hub for community-driven contributions, documentation, and project tracking of the OpenScope Predictive Proce...
Python · 26 estrellas
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aind-ephys-spikesort-kilosort25-full
CodeOcean capsule for full electrophysiology analysis pipeline using Kilosort2.5 via SpikeInterface.
Python · 14 estrellas
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aind-large-scale-cellpose
Large-scale cell segmentation with cellpose.
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Rhapso
An open-source Python toolkit for large-scale fluorescence microscopy data alignment and fusion.
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dynamic-foraging-task
Bonsai/Harp workflow for Dynamic Foraging with Python GUI for visualization and control
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aind-smartspim-pipeline
Repository that hosts the SmartSPIM pipeline code
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TigerASI
a lightweight python interface for ASI brand Tiger Controllers
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wavpack-numcodecs
Numcodecs implementation of the WavPack audio codec
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anivia
Fork of VGG VIA to better support annotation of animal pose images
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harp.device.treadmill-driver
0326: a Harp-compatible device for controlling an instrumented mouse treadmill
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voxel-classic
General purpose microscope control repository
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view
Model/View for exa-spim
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harp.device.lickety-split
0360: an ephys-compliant capacitive lick detector
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Automatic detection of probe position from multiple camera views
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aind-SmartSPIM-segmentation
segmentation module for SmartSPIM cloud pipeline
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Stitching and fusion pipeline in the cloud
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aind-smartspim-ccf-registration
Registration of lightsheet whole brain images to the Allen CCF V3 Atlas
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Add segmentation module Abiertoenhancement
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Unprintable USBxpress exceptions Abierto
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Timeout exception Abierto
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joystick axes should be remapped Abierto
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Multiscan Ability Abierto
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Check System Memory Abiertoworking_on_it
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Python "Class"ification Refactor Abiertoneeds_hardware_test
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Improved Hardware Agnosticism Abiertoarchitecture
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Coherent Genesis Laser Driver Abierto
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Log File Quirks Abierto
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