AllenNeuralDynamics / AllenNeuralDynamics/lightsheet-compression-tests

Add segmentation module

Offen
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enhancement
Vorherrschende Sprache
Jupyter Notebook
Sterne
1
Forks
1
PR-Merge-Kennzahlen
Keine gemergten PRs in 30 T.

Beschreibung

Ideally, the segmentation approach should be agnostic to both input and output data format (Zarr, Tiff, HDF5).
The simplest approach would be to threshold.
More sophisticated approaches could make use of machine learning classifiers (e.g., random forest, unet)

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