AllenNeuralDynamics / AllenNeuralDynamics/aind-ophys-extraction

Don't use photostimulated frames for ROI detection when using CaImAn

Ouverte
#31 0 commentaires 0 réactions 1 personne assignée Réclamée par @j-friedrich Voir sur GitHub
Langage dominant
Python
Étoiles
0
Forks
1
Métriques de merge des PR
Aucune PR mergée en 30 j

Description

Get the ROIs on subset of the data without photostimulation, then extract traces on the full data, as we already do for Cellpose or Suite2p initialization

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