Chủ sở hữu
AllenCell
Đã lập chỉ mục 20 kho mã nguồn · Xem trên GitHub
-
vole-core
core rendering canvas and data loading services for Vol-E volume viewer
TypeScript · 106 star
-
agave
High quality visualization for volumetric image data
C++ · 62 star
-
Python · 32 star
-
Python · 32 star
-
aics-segmentation
Part 1 of Allen Cell and Structure Segmenter: classic image segmentation workflow
Jupyter Notebook · 26 star
-
cvapipe_analysis
Analysis of data produced by cvapipe for the variance paper
Jupyter Notebook · 24 star
-
Python · 24 star
-
napari-allencell-segmenter
A plugin that enables image segmentation provided by Allen Institute for Cell Science
Python · 20 star
-
segmenter_model_zoo
scripts and API for running Deep Learning models from segmenter
Jupyter Notebook · 10 star
-
Python · 7 star
-
benchmarking_representations
Benchmarking different methods for extracting unsupervised representations from images
Python · 7 star
-
allencell-segmenter-ml
Napari plugin for ml segmentation
Python · 5 star
-
endothelial-pipeline
Dynamics of ML-based morphological features indicate a shear stress-dependent bifurcation of hiPSC-derived endothelial cell states
Python · 2 star
-
cell-feature-explorer
Plot and explore data that is linked to images, with an embedded viewer
TypeScript · 2 star
-
EMT_data_analysis
This repo contains code for EMT deliverable data analysis and has dependencies associated with output from EMT_image_analysis repo.
Python · 1 star
-
Python · 0 star
-
camera-alignment-core
Core algorithms for alignment of two-camera microscopy imagery
Python · 0 star
-
cellpack-client
Frontend interface for cellPACK
TypeScript · 0 star
-
cell-catalog
Cell catalog 2.0
TypeScript · 0 star
-
TypeScript · 0 star
-
Tutorial/App Usage Overview Đang mởux
AllenCell/cell-feature-explorer#142 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao ·
-
isolate selections in plot Đang mởux
AllenCell/cell-feature-explorer#146 · 2 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
ux
AllenCell/cell-feature-explorer#149 · 2 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao ·
-
chromebook support Đang mởux
AllenCell/cell-feature-explorer#153 · 3 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
Help Section Designs for CFE Đang mởux
AllenCell/cell-feature-explorer#155 · 3 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
AllenCell/cell-feature-explorer#156 · 1 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
AllenCell/cell-feature-explorer#158 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao ·
-
AllenCell/cell-feature-explorer#167 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
bug good first issue
AllenCell/cell-feature-explorer#169 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
AllenCell/cellpack-client#102 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
MVP v2 interaction flow check Đang mởUX
AllenCell/cellpack-client#125 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao ·
-
MVP v2 styling check & document Đang mởUX
AllenCell/cellpack-client#126 · 1 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao ·
-
AllenCell/cellpack-client#163 · 0 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao ·
-
Ideas for the future Đang mở
AllenCell/cellpack-client#164 · 2 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
AllenCell/cellpack-client#169 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
size: 4 - large (1 - 4 hr) type: docs
AllenCell/endothelial-pipeline#240 · 1 bình luận · 2 reaction · 1 người được giao ·
-
AllenCell/endothelial-pipeline#1645 · 3 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
Refactor `plot_2d_latent_walk` Đang mở
AllenCell/endothelial-pipeline#1827 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
bug good first issue
AllenCell/cell-feature-explorer#170 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
AllenCell/cell-feature-explorer#171 · 1 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
bug
AllenCell/cell-feature-explorer#172 · 2 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
AllenCell/cell-feature-explorer#173 · 1 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
styling on tabs Đang mởbug good first issue
AllenCell/cell-feature-explorer#178 · 1 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
good first issue
AllenCell/cell-feature-explorer#179 · 1 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
bug enhancement
AllenCell/cell-feature-explorer#180 · 1 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
bug good first issue
AllenCell/cell-feature-explorer#181 · 1 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
bug
AllenCell/cell-feature-explorer#182 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
scroll bar overlaps gallery edge Đang mởbug
AllenCell/cell-feature-explorer#183 · 1 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao ·
-
bug good first issue
AllenCell/cell-feature-explorer#184 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
AllenCell/cell-feature-explorer#186 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
good first issue
AllenCell/cell-feature-explorer#189 · 1 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
incorporate viewer link sharing Đang mở
AllenCell/cell-feature-explorer#190 · 2 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
bug
AllenCell/cell-feature-explorer#191 · 1 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
AllenCell/cell-feature-explorer#192 · 1 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
AllenCell/cell-feature-explorer#196 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
Address scroll bar styling Đang mở
AllenCell/cell-feature-explorer#198 · 1 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
AllenCell/cell-feature-explorer#199 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
AllenCell/cell-feature-explorer#200 · 3 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
AllenCell/cell-feature-explorer#202 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
can create selections of 0 cells Đang mở
AllenCell/cell-feature-explorer#204 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
"x histogram" text hard to see Đang mở
AllenCell/cell-feature-explorer#205 · 1 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao ·
-
AllenCell/cell-feature-explorer#206 · 1 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
enhancement
AllenCell/cell-feature-explorer#219 · 0 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
ux
AllenCell/cell-feature-explorer#232 · 3 bình luận · 0 reaction · 1 người được giao ·
-
Filter by features in CFE Đang mởComputational Requests custom data feature request enhancement
AllenCell/cell-feature-explorer#233 · 3 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
Group by multiple features Đang mởcustom data feature request enhancement
AllenCell/cell-feature-explorer#234 · 2 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
Computational Requests custom data feature request enhancement
AllenCell/cell-feature-explorer#235 · 2 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
add "shapes" to plot Đang mởComputational Requests custom data feature request
AllenCell/cell-feature-explorer#236 · 1 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
bug
AllenCell/cell-feature-explorer#238 · 2 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·
-
Computational Requests enhancement question ux
AllenCell/cell-feature-explorer#241 · 3 bình luận · 0 reaction · 0 người được giao ·