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AllenCell
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vole-core
core rendering canvas and data loading services for Vol-E volume viewer
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agave
High quality visualization for volumetric image data
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Part 1 of Allen Cell and Structure Segmenter: classic image segmentation workflow
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cvapipe_analysis
Analysis of data produced by cvapipe for the variance paper
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A plugin that enables image segmentation provided by Allen Institute for Cell Science
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scripts and API for running Deep Learning models from segmenter
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benchmarking_representations
Benchmarking different methods for extracting unsupervised representations from images
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Napari plugin for ml segmentation
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endothelial-pipeline
Dynamics of ML-based morphological features indicate a shear stress-dependent bifurcation of hiPSC-derived endothelial cell states
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cell-feature-explorer
Plot and explore data that is linked to images, with an embedded viewer
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EMT_data_analysis
This repo contains code for EMT deliverable data analysis and has dependencies associated with output from EMT_image_analysis repo.
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Core algorithms for alignment of two-camera microscopy imagery
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Frontend interface for cellPACK
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Cell catalog 2.0
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create Model class オープンrefactor
AllenCell/allencell-segmenter-ml#500 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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🚨 high priority🚨 bug
AllenCell/allencell-segmenter-ml#502 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 ·
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AllenCell/allencell-segmenter-ml#504 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 ·
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bug
AllenCell/allencell-segmenter-ml#505 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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needs clarification needs prioritization
AllenCell/allencell-segmenter-ml#506 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 ·
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AllenCell/allencell-segmenter-ml#509 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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AllenCell/allencell-segmenter-ml#510 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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refactor
AllenCell/allencell-segmenter-ml#521 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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refactor
AllenCell/allencell-segmenter-ml#522 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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refactor
AllenCell/allencell-segmenter-ml#523 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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🚨 high priority🚨
AllenCell/allencell-segmenter-ml#525 · コメント 3 件 · リアクション 0 件 · 担当者 2 名 ·
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bug needs prioritization
AllenCell/allencell-segmenter-ml#526 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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bug needs prioritization
AllenCell/allencell-segmenter-ml#527 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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test オープンneeds prioritization Requests
AllenCell/allencell-segmenter-ml#532 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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Thresholding オープン🚨 high priority🚨 Requests v1
AllenCell/allencell-segmenter-ml#533 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 ·
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Iterative training オープン🚨 high priority🚨 Requests v1
AllenCell/allencell-segmenter-ml#534 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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fewfewfew オープンneeds prioritization Requests
AllenCell/allencell-segmenter-ml#536 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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needs prioritization Requests
AllenCell/allencell-segmenter-ml#541 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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User docs オープン🚨 high priority🚨
AllenCell/allencell-segmenter-ml#543 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 ·
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needs prioritization Requests
AllenCell/allencell-segmenter-ml#546 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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test オープン
AllenCell/allencell-segmenter-ml#559 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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test オープンneeds prioritization Requests
AllenCell/allencell-segmenter-ml#560 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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test オープン
AllenCell/allencell-segmenter-ml#562 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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AllenCell/allencell-segmenter-ml#563 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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AllenCell/allencell-segmenter-ml#564 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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Testing オープン
AllenCell/allencell-segmenter-ml#566 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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AllenCell/allencell-segmenter-ml#568 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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🚨 high priority🚨 refactor
AllenCell/allencell-segmenter-ml#578 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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🚨 high priority🚨 refactor
AllenCell/allencell-segmenter-ml#579 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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🚨 high priority🚨 refactor
AllenCell/allencell-segmenter-ml#580 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 ·
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needs prioritization Requests
AllenCell/allencell-segmenter-ml#584 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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needs prioritization Requests
AllenCell/allencell-segmenter-ml#585 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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needs prioritization Requests
AllenCell/allencell-segmenter-ml#587 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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needs prioritization Requests
AllenCell/allencell-segmenter-ml#588 · コメント 2 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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UI/UX
AllenCell/allencell-segmenter-ml#589 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 ·
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needs prioritization Requests
AllenCell/allencell-segmenter-ml#591 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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needs prioritization Requests
AllenCell/allencell-segmenter-ml#592 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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low priority needs prioritization refactor
AllenCell/allencell-segmenter-ml#599 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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needs prioritization Requests
AllenCell/allencell-segmenter-ml#603 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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change overlap to .2 オープンneeds prioritization Requests
AllenCell/allencell-segmenter-ml#604 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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AllenCell/allencell-segmenter-ml#605 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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needs prioritization Requests
AllenCell/allencell-segmenter-ml#610 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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AllenCell/allencell-segmenter-ml#611 · コメント 2 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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AllenCell/allencell-segmenter-ml#612 · コメント 2 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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needs prioritization Requests
AllenCell/allencell-segmenter-ml#613 · コメント 3 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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AllenCell/allencell-segmenter-ml#627 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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AllenCell/allencell-segmenter-ml#633 · コメント 1 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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AllenCell/allencell-segmenter-ml#634 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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needs prioritization Requests
AllenCell/allencell-segmenter-ml#636 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 0 名 ·
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documentation needs grooming
AllenCell/napari-allencell-segmenter#55 · コメント 0 件 · リアクション 0 件 · 担当者 1 名 ·