AllenCell / AllenCell/napari-allencell-segmenter

Batch processing - Include workflow file in log file

Aberta
#100 0 comentários 0 reações 1 responsável Reivindicada por @yrkim98 Ver no GitHub
engine enhancement
Linguagem predominante
Python
Estrelas
20
Forks
8
Métricas de merge de PRs
Nenhum PR com merge em 30d

Descrição

## Use Case
I think it would be useful for the plugin user to have a record of which workflow was used to generate the files in the output directory.

## Solution
Include the name (and path?) of the workflow json file used for the batch processing at the top of the log file. For example:
```
Batch processing run with workflow /Users/nahyung.choi/Documents/Test Files/sec61b_workflow.json

SUCCESS: /Users/nahyung.choi/Documents/Test Files/batch_input/test_sample_single.tiff. Output saved at /Users/nahyung.choi/Documents/Test Files/batch_output/test_sample_single.segmentation.tiff
SUCCESS: /Users/nahyung.choi/Documents/Test Files/batch_input/tutorial-mitochondria_1.ome.tif. Output saved at /Users/nahyung.choi/Documents/Test Files/batch_output/tutorial-mitochondria_1.ome.segmentation.tiff
2/2 files were successfully processed.
```

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