[Bug] 3.11.2 重启后自定义 provider 全部丢失：provider 家族引导重建 config.json 时未迁移 source:custom 的自定义 provider

提交前确认 · Pre-submission checklist

• 我已搜索过现有 issue，确认这不是重复（最接近的是 #272（已合并到 #268），但其根因是自定义 dataBaseDir 存储路径不一致；本 issue 是默认存储路径下、provider 家族引导重建 config.json 导致的丢失，根因环节不同）
• 我已阅读 CONTRIBUTING.md

问题类别 · Category

模型设置 / 切换 · Model config

涉及的 Agent 框架 · Agent framework

ZCode Agent（自研）

严重程度 · Severity

影响体验 · Major（配置数据静默丢失：自定义 provider 的 baseURL / API Key / 模型列表全部丢失，需手动重建；Key 无法找回时损失更大）

复现频率 · Reproducibility

仅一次 · Once（见下文"一次性"说明）

问题描述 · Description

Windows 桌面版 3.11.2。自定义 provider（UUID 形态 id、source: custom）仅持久化于 ~/.zcode/v2/config.json。2026-09-12 晚托盘退出并重启 ZCode 后，该文件被应用重写，只剩 6 个 builtin provider，所有自定义 provider（含 API Key）被静默丢弃，无任何提示或备份。

关键证据：

• 重写后的 builtin 条目均带 "source": "custom"，且 setting.json 新增 providerFamilyDomain / providerFamilyDomainMigrated / modelProviderFamilyModes / modelProviderFamilySelectedKeys 字段——指向 provider 家族引导/迁移逻辑重建 provider 注册表时，未迁移非家族 ID 的 custom provider。
• 版本全天为 3.11.2 未变化（auto-update 日志：already up to date (local=3.11.2, remote=3.11.2)），排除升级触发。
• 当晚 20:42 重启后自定义 provider 仍在正常工作（日志中百炼 anthropic endpoint 作为 runtimeModel 加载），丢失发生在其后一次重启的 20:53–20:55 config.json 重写。
• 手工恢复配置后，应用随后多次重写 config.json 均完整保留自定义 provider——说明清洗是一次性迁移行为，迁移通过后不再复发。

复现步骤 · Steps to reproduce

1. 在 3.11.2 配置若干自定义 provider（config.json 中 source: custom、UUID 形态 id），正常使用多日
2. 托盘退出 ZCode，重新启动（期间触发 provider 家族引导/迁移）
3. 打开模型设置：自定义 provider 全部消失；检查 ~/.zcode/v2/config.json 仅剩 builtin provider

（触发条件与家族引导/迁移的精确对应关系未能从日志定位到具体代码行，但重写者为应用自身，时间窗口与写盘行为吻合。）

期望表现 · Expected behavior

• 迁移/重建 provider 注册表时保留所有 source: custom 的自定义 provider
• 若确需清洗配置，先自动落一份 config.json.bak 并提示用户

实际表现 · Actual behavior

• config.json 被重写为仅含 builtin provider，自定义 provider 及其 API Key 静默丢失，无提示、无备份
• 应用内无法找回；第三方网关类 Key 只能手动重建

ZCode 版本 · ZCode version

3.11.2（Windows 桌面版）

设备 / 系统 / 浏览器 · Device / OS / Browser

Windows 10 Pro 22H2 (19045) x64

截图 / 录屏 / 日志 · Screenshots / Recordings / Logs

日志时间线（~/.zcode/v2/logs/2026-09-12.log，日志中 Key 已由应用脱敏）：

[2026-09-12 20:38:31] [app-quit] explicit quit requested (tray-quit)
[2026-09-12 20:38:37] [arms] electron initialized env=prod version=3.11.2
  （setting.json 随后写入 providerFamilyDomain=bigmodel / providerFamilyDomainMigrated=true）
[2026-09-12 20:42:11] [zcode-agent-service] 开始请求 workspace/readState
  {"hasRuntimeModel":true,"runtimeModel":{"apiFormat":"anthropic-messages",
   "baseURL":"https://llm-***.cn-beijing.maas.aliyuncs.com/apps/anthropic","kind":"anthropic",...}}
  ← 自定义 provider 仍在正常工作
[2026-09-12 20:43:12] [arms] electron initialized env=prod version=3.11.2
[2026-09-12 20:53-20:55] config.json / setting.json 被重写；重写后 config.json 仅含 6 个
  builtin provider（均带 "source":"custom"），多个 UUID 形态的自定义 provider 全部消失

补充说明（恢复路径，供研发参考）：旧配置可从本机 ~/.zcode/cli/db/db.sqlite（任务索引保存了历史会话完整读取 config.json 的工具结果）与系统卷影副本部分重建，代价较高；若应用在重写前自动备份一份旧 config.json，用户即可完全免于手工恢复。

Start by inspecting the provider-family migration or registry-rebuild path that rewrites ~/.zcode/v2/config.json, using the 20:53–20:55 entries in ~/.zcode/v2/logs/2026-09-12.log as the timeline. Compare the rebuilt entries with setting.json fields such as providerFamilyDomainMigrated and modelProviderFamilyModes. Done means source: custom providers, including UUID IDs, survive migration; if cleanup remains necessary, config.json is backed up first.