Ошибка замещения всей конфигурации по разборе очередного шага

Столкнулся с проблемой, когда при разборе истории хранилища вместо помещения только затронутых в изменении объектов перезаписываются фактически все файлы.
Например есть изменение, создающее отчет с парой форм:

Версия:		168
Пользователь:	Пермяков Алексей
Дата создания:	11.10.2015
Время создания:	11:34:15
Пустой комментарий. (fix)
	Добавлены	4
	Отчет.РегламентированныйОтчетФормаКорпоративная49Год
	Отчет.РегламентированныйОтчетФормаКорпоративная49Год.Макет.ФормаОтчета2015_Годовая_ФормаОтчета
	Отчет.РегламентированныйОтчетФормаКорпоративная49Год.Форма.ОсновнаяФорма
	Отчет.РегламентированныйОтчетФормаКорпоративная49Год.Форма.ФормаОтчета2015Годовая
	Изменены	1
	ООСреды

В конфигураторе 1С нет ничего необычного. Но после выполнения команды:
gitsync export "\\####\repositories\OOS_GP10" "C:\Jenkins\workspace\OOS\Sync1CtoGit\OOS_2_0\src" -limit 1
получается коммит, содержащий вот такое количество изменений:

git diff --shortstat origin/develop_src develop_src 
 1970 files changed, 4138 insertions(+), 659461 deletions(-)

Откат изменения и повторный разбор дают такой же результат.

Start by reproducing gitsync export "\\####\repositories\OOS_GP10" "C:\Jenkins\workspace\OOS\Sync1CtoGit\OOS_2_0\src" -limit 1 and compare the resulting git diff --shortstat. Trace how the next storage-history step is parsed and exported; done means the commit contains only the four added objects and one changed object rather than thousands of unrelated files.