fieldtrip / fieldtrip/website

computation t values incorrect on nirs example page

Open
#670 0 comments 0 reactions 1 assignee Claimed by @robertoostenveld View on GitHub
Dominant language
Python
Stars
44
Forks
107
PR merge metrics
No merged PRs in 30d

Description

@StolkArjen reported in a personal message that on page https://www.fieldtriptoolbox.org/example/nirs_glm/

```
Onderaan de pagina worden de beta waarden in t waarden geconverteerd: t = (c' * b) ./ sqrt(var(e) * (c' * (x'*x) * c))

Ik vraag me of dit het volgende dient te zijn: t = (c' * b) ./ sqrt(var(e) * (c' * inv(x'*x) * c)) << nadruk op de inverse

In ft_statfun_indepsamplesregrT wordt ook de inverse matrix gebruikt voor de SE berekening (invcpmat):

cpmat = designmat'*designmat;
invcpmat = inv(cpmat);

En even later:

se=sqrt(invcpmat(nblocks+1,nblocks+1)*resvar);
s.stat=B(:,nblocks+1)./se;

Als ik de inverse gebruik in de formule van het example script, krijg ik dezelfde t-waarden als met ft_statfun_indepsamplesregrT en als met bijv. glmfit (matlab functie)
```

and I believe he is right.

Contributor guide

No contributing guide indexed for this repository

Assessment

This issue has not been assessed yet.

Get new issues in your inbox

A short digest of beginner-friendly GitHub issues.