Owner

aplbrain

31 indexierte Repositories · Auf GitHub ansehen

grand-cypher
Implementation of the Cypher language for searching NetworkX graphs

Python · 129 Sterne
grand
Your favorite Python graph libraries, scalable and interoperable. Graph databases in memory, and familiar graph APIs for cloud databases.

Python · 116 Sterne
npyjs
Read numpy .npy files in JavaScript

TypeScript · 99 Sterne
grandiso-networkx
Performant, pure-Python subgraph isomorphism and monomorphism search (aka "motif search")

Python · 66 Sterne
saber

Python · 17 Sterne
bossdb_cookbook
The BossDB Cookbook is a collection of introductory notebooks and examples for interfacing with the BossDB system.

Jupyter Notebook · 6 Sterne
cloudome
Execute highly parallelizable jobs on volumetric neuroscience datasets

Python · 6 Sterne
grandiso-cloud

Python · 4 Sterne
neuromorpholib

Python · 4 Sterne
pm2m
Probabilistic motifs to models

Jupyter Notebook · 4 Sterne
colocar
tools for sparse human annotation of three-dimensional [neuroscience] datasets

JavaScript · 4 Sterne
bossypaints
Web-based dense annotation tool for connectomics

Svelte · 3 Sterne
bossphorus-python
bossphorus is a simple volumetric datastore for dense 3D data.

Python · 2 Sterne
BENCHMARK-Metadata
Metadata specification and upload instructions for BossDB images, experiments, and annotations

2 Sterne
bossphorus
A BossDB-like volumetric datastore in Rust

Rust · 1 Stern
precomputed-rs

Rust · 1 Stern
bossdb-rag-chatbot
A Language Interface to the BossDB Ecosystem

Python · 1 Stern
neuvue-queue

TypeScript · 1 Stern
motifstudio

TypeScript · 1 Stern
vsvi2precomputed
Script to convert VSVI (used in VAST) image datasets to precomputed volumes

Python · 1 Stern
11 weitere Repositories liegen auf Auf GitHub ansehen

Offen Alle

Bisher 149 offene Issues indexiert

Separate Vector Database Build Pipeline Offen

enhancement

aplbrain/bossdb-rag-chatbot#2 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Support Tool Usage and Reasoning Offen

enhancement

aplbrain/bossdb-rag-chatbot#3 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Add support for loading JavaScript-rendered content Offen

aplbrain/bossdb-rag-chatbot#4 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Memory Build Up Offen

bug

aplbrain/bossdb-rag-chatbot#7 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
set up ci/cd Offen

aplbrain/bossdb-rag-chatbot#12 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
NWB NDX Pose EP Offen

aplbrain/BBQS-EMBER-Data-Model#33 · 9 Kommentare · 2 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
zoom to center of FOV instead of center of image Offen

app:breadcrumbs good first issue in progress

aplbrain/colocar#20 · 5 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Throw errors on fetch failure Offen

enhancement

aplbrain/colocar#162 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Zenodo DOI? Offen

aplbrain/ember-dandi-access-summaries#1 · 5 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Create task attribute for arbitrary notes Offen

aplbrain/neuvue-queue#3 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Add export feature for tasks/points Offen

aplbrain/neuvue-queue#4 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
convert created/started times to arrays to keep track of proofreader time Offen

aplbrain/neuvue-queue#5 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Add tags to task Offen

aplbrain/neuvue-queue#17 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Automatically reassign public tasks which have been open for N days Offen

enhancement

aplbrain/neuvue-queue#27 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
GET points and GET tasks require a q param to work properly Offen

bug

aplbrain/neuvue-queue#28 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
checkbox to select multiple downloads Offen

enhancement good first issue

aplbrain/bossypaints#24 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Add support to modify existing segmentation Offen

enhancement

aplbrain/bossypaints#28 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Mutli-user tasks Offen

aplbrain/bossypaints#29 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Support pulling the OBJ meshes from Checkpoint Export ngl Offen

aplbrain/bossypaints#33 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Bug: Neuroglancer URL Parsing Offen

aplbrain/bossypaints#38 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Disable background events while Keybindings Table is shown Offen

bug

aplbrain/bossypaints#39 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Touchscreen UI/UX Improvements Offen

enhancement

aplbrain/bossypaints#41 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Add a `restart` policy to the docker compose config Offen

aplbrain/bossypaints#47 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Sanes R34DA059513 Offen

aplbrain/sleap-docker-container#8 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Jacobs R61MH135405 Offen

aplbrain/sleap-docker-container#9 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Shepherd R34DA059513 Offen

aplbrain/sleap-docker-container#10 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Suppress progress bars to reduce log spam Offen

aplbrain/sleap-docker-container#11 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
add query cache Offen

aplbrain/motifstudio#28 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Add ability to proxy host listings to neuPrint or other providers Offen

enhancement

aplbrain/motifstudio#31 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Add DynamoDB batch insertion retries and error management Offen

aplbrain/grand#3 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Neo4j backend? Offen

backends enhancement question

aplbrain/grand#41 · 2 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Multi-edges between two nodes Offen

aplbrain/grand#52 · 4 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Add rustworkx backend Offen

backends enhancement

aplbrain/grand#57 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Add unit tests and a Github workflow to run the tests on multiple operating systems Offen

aplbrain/vsvi2precomputed#3 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Support other vast formats Offen

aplbrain/vsvi2precomputed#5 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Use MipMapFileNameTemplate for file path instead of SourceFileNameTemplate Offen

aplbrain/vsvi2precomputed#7 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Graph mutations? Offen

enhancement question

aplbrain/grand-cypher#19 · 5 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
OPTIONAL MATCH Offen

aplbrain/grand-cypher#21 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Support for Equijoins Offen

bug

aplbrain/grand-cypher#38 · 6 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Negated edges Offen

aplbrain/grand-cypher#49 · 2 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Feature Request: Support for ANY Clause in WHERE for List Filtering Offen

enhancement language

aplbrain/grand-cypher#51 · 5 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Feature request: grammar / `WHERE` namespace extensions Offen

aplbrain/grand-cypher#58 · 8 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Support passing `hints` in grandiso Offen

enhancement performance

aplbrain/grand-cypher#63 · 3 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Support automatic generation of hints from `WHERE` clauses Offen

aplbrain/grand-cypher#69 · 2 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Find siblings including self Offen

aplbrain/grand-cypher#70 · 2 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Variable length relationship defaults differ from neo4j cypher specs Offen

aplbrain/grand-cypher#77 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
duplicated hints leads to duplicated result Offen

aplbrain/grand-cypher#81 · 6 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
grandiso hints doesn't check _is_edge_attr_match and _is_node_attr_match. Offen

bug

aplbrain/grand-cypher#84 · 3 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
is_edge_attr_match fails on attribs other than labels Offen

aplbrain/grand-cypher#85 · 4 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
support labels indexing and hint generator Offen

aplbrain/grand-cypher#88 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026

aplbrain

Neue Issues direkt in Ihr Postfach