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aolabNeuro

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analyze
Code for specific analysis computations on processed data (e.g. spectral coherence)

Python · 7 estrellas

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85 issues abiertos indexados

(still updating) New environment: possible import/update bugs Abierto

bug

aolabNeuro/analyze#413 · 3 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
preproc overwrite doesn't fully overwrite Abierto

bug

aolabNeuro/analyze#417 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
delete old postproc functions Abierto

invalid

aolabNeuro/analyze#420 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
hand and cursor kinematics in different coordinate systems Abierto

bug high priority invalid preprocessing

aolabNeuro/analyze#421 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
update spectrogram code to be more consistent Abierto

enhancement

aolabNeuro/analyze#423 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
target indices assumed to start at zero Abierto

bug

aolabNeuro/analyze#424 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
tabulate data makes target locations into a list Abierto

invalid

aolabNeuro/analyze#427 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
rotate_spatial_data outputs different dimensions if no rotation is applied Abierto

bug

aolabNeuro/analyze#434 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
tabulate_behavior_data should tell you which file went wrong Abierto

enhancement

aolabNeuro/analyze#438 · 2 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
documentation for earlier versions of aopy Abierto

aolabNeuro/analyze#441 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
channel maps not centered Abierto

inconsistency

aolabNeuro/analyze#464 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
plot sessions by trial enhancement Abierto

aolabNeuro/analyze#477 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
tabulate_behavior_data and random target chains Abierto

enhancement

aolabNeuro/analyze#479 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
tabulate functions need try/except Abierto

inconsistency

aolabNeuro/analyze#488 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
remove get_filenames_in_dir() Abierto

inconsistency

aolabNeuro/analyze#489 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
have a way to see which preprocessed files exist Abierto

enhancement

aolabNeuro/analyze#490 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
figure saving function Abierto

enhancement

aolabNeuro/analyze#495 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
enhance tabulate behavior data Abierto

enhancement

aolabNeuro/analyze#496 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Trial segments identified in tabulate function may contain multiple actual trials if pause bug occurred Abierto

bug

aolabNeuro/analyze#500 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
tabulate_behavior_data() needs a way to handle data missing ecube Abierto

bug

aolabNeuro/analyze#501 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Best way to tabulate data when sync_events and bmi3d_events are different Abierto

inconsistency

aolabNeuro/analyze#502 · 2 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
calc_mt_tfr time axis not correct if step size not divisible into sampling rate Abierto

aolabNeuro/analyze#510 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
accllr enhancements Abierto

bug enhancement

aolabNeuro/analyze#515 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
utils.convert_channels_to_mask stops working if more than 53 channels are inputted Abierto

bug

aolabNeuro/analyze#535 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
get_data_segment error message not helpful Abierto

documentation

aolabNeuro/analyze#550 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Error in Docstring Abierto

aolabNeuro/analyze#566 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
add feature selection functions Abierto

enhancement

aolabNeuro/analyze#623 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
proc_eyetracking docstring is missing an argument Abierto

documentation

aolabNeuro/analyze#630 · 0 comentarios · 1 reacción · 2 asignados · Indexado el 13/9/2026
tabulate_behavior_center_out reward column is float64 instead of bool datatype Abierto

aolabNeuro/analyze#665 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
events['timestamp'] is nan when data has bmi3d but no ecube data Abierto

inconsistency preprocessing

aolabNeuro/analyze#675 · 2 comentarios · 0 reacciones · 2 asignados · Indexado el 13/9/2026
get mapping doesn’t take limits into account Abierto

aolabNeuro/analyze#686 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
_correct_hand_traj no longer needed Abierto

inconsistency

aolabNeuro/analyze#742 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
multiprocessing not necessary in ECoG analysis example Abierto

invalid

aolabNeuro/analyze#744 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
tablet engagement func counts NaN values as "engaged" Abierto

aolabNeuro/analyze#747 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Add delay period to center out Tabulate function Abierto

aolabNeuro/analyze#753 · 0 comentarios · 0 reacciones · 2 asignados · Indexado el 13/9/2026

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