DiamondLightSource/python-murfey

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Client-Server architecture hauling Cryo-EM data around systems

Stelle: 2
Fork: 1
Issue aperte per principianti: 0
Issue indicizzate: 34
Merge medio: 1g 10h
PR unite (30g): 19

Lingua principale: Python
Licenza: BSD-3-Clause
Ultimo push su GitHub: 11/9/2026
Ultima indicizzazione: 15/9/2026
Guida per i contributori: Nessuna guida per i contributori
Codice di condotta: Nessun codice di condotta
Label per principianti: Nessuna label per principianti indicizzata

Aperta Tutte

34 issue aperte indicizzate

Add a time API call to get current server time Aperta

DiamondLightSource/python-murfey#56 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 15/9/2026
Show pixel size in Angstroms Aperta

DiamondLightSource/python-murfey#111 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 15/9/2026
Configurable processing and processing parameters Aperta

DiamondLightSource/python-murfey#151 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 15/9/2026
Add more tests for server side Aperta

DiamondLightSource/python-murfey#195 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 15/9/2026
Register processing parameters to provide users with more detail Aperta

DiamondLightSource/python-murfey#199 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 15/9/2026
Add option to disable alertmanager monitoring Aperta

DiamondLightSource/python-murfey#200 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 15/9/2026
Record dose for each movie as measured during acquisition Aperta

DiamondLightSource/python-murfey#213 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 15/9/2026
Better handling of ISPyB lookup of session ID failure needed Aperta

DiamondLightSource/python-murfey#229 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 15/9/2026
Record position tracking data in ISPyB tables Aperta

position tracking

DiamondLightSource/python-murfey#234 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 15/9/2026
Develop unit tests for API endpoints Aperta

DiamondLightSource/python-murfey#235 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 15/9/2026
When destinations are explicitly added for existing sources they should be created Aperta

DiamondLightSource/python-murfey#236 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 15/9/2026
Coordination of different rsync threads Aperta

DiamondLightSource/python-murfey#251 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 15/9/2026
Murfey for CryoCLEM Aperta

cryo-clem enhancement

DiamondLightSource/python-murfey#288 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 15/9/2026
Remove the tilt offset parameter for tomography Aperta

DiamondLightSource/python-murfey#347 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 15/9/2026
Handle instrument server post failures Aperta

DiamondLightSource/python-murfey#348 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 15/9/2026
Refactor SQL tables, API endpoints, and feedback-callback function into submodules Aperta

enhancement

DiamondLightSource/python-murfey#375 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 15/9/2026
Murfey server still looks for security configuration file path from environment variable instead of machine configuration Aperta

bug server

DiamondLightSource/python-murfey#397 · 2 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 15/9/2026
RSync URL for instrument server setup Aperta

DiamondLightSource/python-murfey#474 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 15/9/2026
Murfey validates ALL MachineConfigs in the MachineConfig file Aperta

bug server

DiamondLightSource/python-murfey#488 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 15/9/2026
Add MachineConfig key to set whether and how permissions are modified when transferring files via rsync Aperta

enhancement

DiamondLightSource/python-murfey#489 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 15/9/2026
Finalising all rsyncers through the instrument server seems to cause connection issues with the database Aperta

bug web ui

DiamondLightSource/python-murfey#530 · 1 commento · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 15/9/2026
No logic to handle case where no microscope image is provided for the frontend Aperta

bug server web ui

DiamondLightSource/python-murfey#551 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 15/9/2026
The "allow_removal" MachineConfig key doesn't work Aperta

client

DiamondLightSource/python-murfey#562 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 15/9/2026
Cleaner rsync still submits messages to server Aperta

bug client

DiamondLightSource/python-murfey#580 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 15/9/2026
The cleanup function doesn't fully wipe the database of entries related to that particular session Aperta

bug server

DiamondLightSource/python-murfey#581 · 1 commento · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 15/9/2026
API endpoints in "murfey.server.api.spa" might be vestigial and can be removed Aperta

DiamondLightSource/python-murfey#596 · 1 commento · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 15/9/2026
Spaces in file paths still cause problems Aperta

DiamondLightSource/python-murfey#619 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 15/9/2026
Add logic to automate XRM data transfer and processing workflow Aperta

client enhancement server xrm

DiamondLightSource/python-murfey#627 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 15/9/2026
Add analyser and context logic for XRM workflow Aperta

DiamondLightSource/python-murfey#628 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 15/9/2026
Add database tables to store XRM workflow metadata as needed Aperta

DiamondLightSource/python-murfey#629 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 15/9/2026
Add server-side endpoints to handle processing of XRM files Aperta

DiamondLightSource/python-murfey#630 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 15/9/2026
CrYOLO model path caching means changes are not detected during collection Aperta

DiamondLightSource/python-murfey#646 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 15/9/2026
Rsyncers don't start correctly on reconnect Aperta

DiamondLightSource/python-murfey#791 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 15/9/2026
Restructure the data collection group tags to use the rsyncer table Aperta

DiamondLightSource/python-murfey#792 · 0 commenti · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 15/9/2026

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