DiamondLightSource/python-murfey

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Client-Server architecture hauling Cryo-EM data around systems

Sterne: 2
Forks: 1
Offene Anfänger-Issues: 0
Indexierte Issues: 34
Ø Merge: 1 T. 10 Std.
Gemergte PRs (30 T.): 19

Vorherrschende Sprache: Python
Lizenz: BSD-3-Clause
Letzter GitHub-Push: 11.9.2026
Zuletzt indexiert: 15.9.2026
Beitragsleitfaden: Kein Beitragsleitfaden
Verhaltenskodex: Kein Verhaltenskodex
Anfänger-Labels: Keine Anfänger-Labels indexiert

Offen Alle

Bisher 34 offene Issues indexiert

Add a time API call to get current server time Offen

DiamondLightSource/python-murfey#56 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Show pixel size in Angstroms Offen

DiamondLightSource/python-murfey#111 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Configurable processing and processing parameters Offen

DiamondLightSource/python-murfey#151 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Add more tests for server side Offen

DiamondLightSource/python-murfey#195 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Register processing parameters to provide users with more detail Offen

DiamondLightSource/python-murfey#199 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Add option to disable alertmanager monitoring Offen

DiamondLightSource/python-murfey#200 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Record dose for each movie as measured during acquisition Offen

DiamondLightSource/python-murfey#213 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Better handling of ISPyB lookup of session ID failure needed Offen

DiamondLightSource/python-murfey#229 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Record position tracking data in ISPyB tables Offen

position tracking

DiamondLightSource/python-murfey#234 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 15.9.2026
Develop unit tests for API endpoints Offen

DiamondLightSource/python-murfey#235 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 15.9.2026
When destinations are explicitly added for existing sources they should be created Offen

DiamondLightSource/python-murfey#236 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Coordination of different rsync threads Offen

DiamondLightSource/python-murfey#251 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 15.9.2026
Murfey for CryoCLEM Offen

cryo-clem enhancement

DiamondLightSource/python-murfey#288 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Remove the tilt offset parameter for tomography Offen

DiamondLightSource/python-murfey#347 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Handle instrument server post failures Offen

DiamondLightSource/python-murfey#348 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Refactor SQL tables, API endpoints, and feedback-callback function into submodules Offen

enhancement

DiamondLightSource/python-murfey#375 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 15.9.2026
Murfey server still looks for security configuration file path from environment variable instead of machine configuration Offen

bug server

DiamondLightSource/python-murfey#397 · 2 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
RSync URL for instrument server setup Offen

DiamondLightSource/python-murfey#474 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Murfey validates ALL MachineConfigs in the MachineConfig file Offen

bug server

DiamondLightSource/python-murfey#488 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Add MachineConfig key to set whether and how permissions are modified when transferring files via rsync Offen

enhancement

DiamondLightSource/python-murfey#489 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 15.9.2026
Finalising all rsyncers through the instrument server seems to cause connection issues with the database Offen

bug web ui

DiamondLightSource/python-murfey#530 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
No logic to handle case where no microscope image is provided for the frontend Offen

bug server web ui

DiamondLightSource/python-murfey#551 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
The "allow_removal" MachineConfig key doesn't work Offen

client

DiamondLightSource/python-murfey#562 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 15.9.2026
Cleaner rsync still submits messages to server Offen

bug client

DiamondLightSource/python-murfey#580 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
The cleanup function doesn't fully wipe the database of entries related to that particular session Offen

bug server

DiamondLightSource/python-murfey#581 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
API endpoints in "murfey.server.api.spa" might be vestigial and can be removed Offen

DiamondLightSource/python-murfey#596 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Spaces in file paths still cause problems Offen

DiamondLightSource/python-murfey#619 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Add logic to automate XRM data transfer and processing workflow Offen

client enhancement server xrm

DiamondLightSource/python-murfey#627 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Add analyser and context logic for XRM workflow Offen

DiamondLightSource/python-murfey#628 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Add database tables to store XRM workflow metadata as needed Offen

DiamondLightSource/python-murfey#629 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Add server-side endpoints to handle processing of XRM files Offen

DiamondLightSource/python-murfey#630 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
CrYOLO model path caching means changes are not detected during collection Offen

DiamondLightSource/python-murfey#646 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Rsyncers don't start correctly on reconnect Offen

DiamondLightSource/python-murfey#791 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026
Restructure the data collection group tags to use the rsyncer table Offen

DiamondLightSource/python-murfey#792 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 15.9.2026

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