AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach

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Vorherrschende Sprache: Python
Lizenz: MIT
Letzter GitHub-Push: 24.4.2026
Zuletzt indexiert: 13.9.2026
Beitragsleitfaden: Kein Beitragsleitfaden
Verhaltenskodex: Kein Verhaltenskodex
Anfänger-Labels: Keine Anfänger-Labels indexiert
PR-Merge-Kennzahlen: Keine gemergten PRs in 30 T.

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Invalid/corrupt metadata files Offen

Metadata

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#17 · 3 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Thalmanac comprehensive pipeline Offen

Analysis

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#34 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Video for generating metadata w/ pydantic Offen

documentation

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#36 · 5 Kommentare · 0 Reaktionen · 3 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Compile list of intermediate/advanced tutorial topics Offen

documentation

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#43 · 2 Kommentare · 0 Reaktionen · 4 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Specimen procedures have an extra field for "subject_id" with a different subject_id than the asset Offen

Metadata

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#51 · 7 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Follow up on model metadata new schema usage Offen

Metadata

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#53 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
MERFISH vs Carter lab data integration Offen

Analysis

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#58 · 2 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Write Data Platform paper Offen

paper

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#69 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 2 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Write Metadata schema paper Offen

paper

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#70 · 2 Kommentare · 0 Reaktionen · 2 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
2D/3D densities from Smartspim cells Offen

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#73 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
CO R user experience support Offen

Analysis

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#77 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Get data out of private buckets Offen

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#78 · 4 Kommentare · 0 Reaktionen · 3 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Write SWDB Databook tutorial on using Xarray Offen

documentation SWDB Workshop

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#79 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Support other atlases in thalmanac Offen

Analysis

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#87 · 2 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Basic example of morphology feature calculation using analysis architecture Offen

Analysis

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#109 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
NWB for slice physiology Offen

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#116 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Create benchmark for aind-metadata-viz llm Offen

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#122 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 0 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
NP Ultra Interneurons data reorganization Offen

SWDB

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#128 · 2 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Add How to cite to morphology portal Offen

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#129 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Publish Data Infrastructure page to AIND Website Offen

Website

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#182 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 2 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Publish population ophys platform page Offen

Website

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#183 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 2 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Publish Virtual Reality Protocol Offen

Protocols

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#201 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Publish Registering MRI Volumes to Ephys Rig Protocol Offen

Protocols

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#211 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 2 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
Publish Mouse Habituation Protocol Offen

Protocols

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#209 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
tool to add s3 mount capability for external use of public CO capsules Offen

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#194 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
share tools for settings sync in codeocean Offen

internal support

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#195 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
adapt processing.json generation for post-capsule usage Offen

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#199 · 3 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
analysis framework example for workshops etc Offen

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#214 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Support for Ulises metadata - derived asset from DANDI data Offen

internal support Metadata

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#215 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Upgrade NP Ultra rig Offen

Metadata

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#216 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
gh action to add tags for CO releases Offen

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#239 · 3 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
clean up quicknii registration code Offen

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#248 · 3 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
explore hosting webalign/warp tools with s3 access Offen

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#249 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
CO syncing github action Offen

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#251 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
support all types in auto-app-panel Offen

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#259 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
find minimal example for bug with pushing to CO git repo Offen

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#261 · 2 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
explore brainrender/vedo/pyvista for CAT session Offen

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#263 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
"Project" level views that are neither project_name or subject_id alone Offen

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#264 · 2 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
script/app to check capsule data status before release Offen

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#265 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
update exaspim LC asset metadata Offen

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#272 · 7 Kommentare · 0 Reaktionen · 2 zugewiesene Personen · Indexiert am 13.9.2026
create CO run scheduler roadmap proposal Offen

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#279 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
pin down work items for thalamus tools manuscript Offen

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#282 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
explore CAJAL embeddings for RT morphology analysis Offen

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#283 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
public collection highlighting commonly used reference data like CCF / ABC atlas Offen

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#285 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
support code release for Thalamus tools manuscript (Marcus) Offen

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#286 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
support exaspim QC Offen

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#290 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
analysis framework pipeline for smartspim injection volume quantification Offen

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#291 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Confocal imaging ingest Offen

Metadata

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#292 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Publish Thick-Tissue Multi-Round RNA-FISH on Expanded Mouse Brain Slices Following in vivo 2-photon Imaging Protocol Offen

Protocols

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#295 · 0 Kommentare · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026
Respiration data challenge Offen

AllenNeuralDynamics/aind_data_outreach#297 · 1 Kommentar · 0 Reaktionen · 1 zugewiesene Person · Indexiert am 13.9.2026

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