AllenNeuralDynamics/aind-software-docs

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Centralized documentation repository for Scientific Computing, publishes to RTD

Stelle: 1
Fork: 0
Issue aperte per principianti: 0
Issue indicizzate: 38
Merge medio: 1g 6h
PR unite (30g): 7

Lingua principale: Python
Licenza: MIT
Ultimo push su GitHub: 11/9/2026
Ultima indicizzazione: 13/9/2026
Guida per i contributori: Nessuna guida per i contributori
Codice di condotta: Nessun codice di condotta
Label per principianti: Nessuna label per principianti indicizzata

Aperta Tutte

38 issue indicizzate finora

Clarify the relationship between acquisition.json and instrument.json Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#45 · 1 commento · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Clarify language around instrument ID in `prepare_before_acquisition.md` Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#46 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
prepare metadata needs some information on how to actual create metadata Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#50 · 2 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
modality-specific process labels Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#54 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Capsule versioning policy Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#64 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Create simple pipeline versioning policy Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#65 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Migrate electrophysiology sharepoint page to software docs Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#73 · 2 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Create analysis diagram Aperta

diagram

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#87 · 1 commento · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
change issue templates to something more appropriate Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#101 · 1 commento · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
High level diagram for lab management Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#110 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
DF use of lab management system Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#111 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Highlight roles and responsibilities on high and mid-level diagrams Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#113 · 1 commento · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Highlight where the DF refactor would need to change to meet proposed architecture guidelines Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#114 · 1 commento · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Add glossary terms/defs Aperta

documentation

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#125 · 1 commento · 0 reazioni · 2 assegnatari · Indicizzata il 13/9/2026
Wrong function signature in dynamic foraging architecture drawing Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#135 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
CCF and brainglobe docs Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#140 · 1 commento · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
more complete navigation / preventing orphaned pages Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#150 · 4 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Make a general 'tools' page and/or rename the Scientific Computing Teams page Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#152 · 1 commento · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
How to convert internal -> external assets (publication standards) Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#153 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
link out to file standards repo Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#154 · 2 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Onboarding intro about what the names mean (metadata core files, etc) Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#155 · 1 commento · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Remove redundant content from SharePoint Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#163 · 1 commento · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
analysis framework docs Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#165 · 1 commento · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
break out project metadata lookup tools to separate page Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#171 · 1 commento · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
updates to scientist-derived data page Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#172 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Recommended workflow for coordinating metadata from different modalities Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#174 · 3 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Add instructions for using Asta on Code Ocean Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#177 · 1 commento · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
add diagram documentation Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#184 · 1 commento · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
tracking vs logging Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#185 · 2 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Create instructions for how to initiate a pipeline run programmatically Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#191 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Clarify multimodal experiment coordination/correlation/metadata in diagrams Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#197 · 1 commento · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Create a diagram for NWB file combining logic Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#200 · 1 commento · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Need documentation on fixing metadata Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#203 · 1 commento · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Add detail on aind-scratch-data assets for scientist-derived data Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#204 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
rebrand docs pages Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#205 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
update outreach events page Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#206 · 0 commenti · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Document Pipeline Standards for multi-backend support Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#214 · 1 commento · 0 reazioni · 1 assegnatario · Indicizzata il 13/9/2026
Document the S3 / DocDB / Code Ocean data-asset contract and consistency expectations Aperta

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#217 · 1 commento · 0 reazioni · 0 assegnatari · Indicizzata il 13/9/2026

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