AllenNeuralDynamics/aind-software-docs

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Centralized documentation repository for Scientific Computing, publishes to RTD

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Forks: 0
Issues débutants ouvertes: 0
Issues indexées: 38
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PR mergées (30 j): 7

Langage dominant: Python
Licence: MIT
Dernier push GitHub: 11/9/2026
Dernière indexation: 13/9/2026
Guide de contribution: Aucun guide de contribution
Code de conduite: Aucun code de conduite
Labels débutants: Aucun label débutant indexé

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38 issues ouvertes indexées

Clarify the relationship between acquisition.json and instrument.json Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#45 · 1 commentaire · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Clarify language around instrument ID in `prepare_before_acquisition.md` Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#46 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
prepare metadata needs some information on how to actual create metadata Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#50 · 2 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
modality-specific process labels Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#54 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Capsule versioning policy Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#64 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Create simple pipeline versioning policy Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#65 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Migrate electrophysiology sharepoint page to software docs Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#73 · 2 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Create analysis diagram Ouverte

diagram

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#87 · 1 commentaire · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
change issue templates to something more appropriate Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#101 · 1 commentaire · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
High level diagram for lab management Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#110 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
DF use of lab management system Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#111 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Highlight roles and responsibilities on high and mid-level diagrams Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#113 · 1 commentaire · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Highlight where the DF refactor would need to change to meet proposed architecture guidelines Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#114 · 1 commentaire · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Add glossary terms/defs Ouverte

documentation

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#125 · 1 commentaire · 0 réactions · 2 personnes assignées · Indexée le 13/9/2026
Wrong function signature in dynamic foraging architecture drawing Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#135 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
CCF and brainglobe docs Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#140 · 1 commentaire · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
more complete navigation / preventing orphaned pages Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#150 · 4 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Make a general 'tools' page and/or rename the Scientific Computing Teams page Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#152 · 1 commentaire · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
How to convert internal -> external assets (publication standards) Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#153 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
link out to file standards repo Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#154 · 2 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Onboarding intro about what the names mean (metadata core files, etc) Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#155 · 1 commentaire · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Remove redundant content from SharePoint Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#163 · 1 commentaire · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
analysis framework docs Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#165 · 1 commentaire · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
break out project metadata lookup tools to separate page Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#171 · 1 commentaire · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
updates to scientist-derived data page Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#172 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Recommended workflow for coordinating metadata from different modalities Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#174 · 3 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Add instructions for using Asta on Code Ocean Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#177 · 1 commentaire · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
add diagram documentation Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#184 · 1 commentaire · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
tracking vs logging Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#185 · 2 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Create instructions for how to initiate a pipeline run programmatically Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#191 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Clarify multimodal experiment coordination/correlation/metadata in diagrams Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#197 · 1 commentaire · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Create a diagram for NWB file combining logic Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#200 · 1 commentaire · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Need documentation on fixing metadata Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#203 · 1 commentaire · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Add detail on aind-scratch-data assets for scientist-derived data Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#204 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
rebrand docs pages Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#205 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
update outreach events page Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#206 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Document Pipeline Standards for multi-backend support Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#214 · 1 commentaire · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Document the S3 / DocDB / Code Ocean data-asset contract and consistency expectations Ouverte

AllenNeuralDynamics/aind-software-docs#217 · 1 commentaire · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 13/9/2026

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