AllenNeuralDynamics / AllenNeuralDynamics/aind-exaSPIM-pipeline-utils

Require specific ImageJ + BigStitcher versions?

Đang mở
#75 0 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub
documentation
Ngôn ngữ chính
Python
Star
1
Fork
1
Chỉ số merge pull request
Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Mô tả

It appears that https://github.com/AllenNeuralDynamics/aind-exaSPIM-pipeline-utils/blob/main/src/aind_exaspim_pipeline_utils/imagej_wrapper.py calls whatever local ImageJ installation the user has installed, irrespective of whether the required plugins are installed and whether the hardcoded macros are still valid for those plugin versions.

It would be useful to either install the correct Fiji dependencies as part of the build process and point to those in the script, or to document which versions of BigStitcher/Fiji are compatible with these scripts

Hướng dẫn đóng góp

Chưa lập chỉ mục được hướng dẫn đóng góp cho kho mã nguồn này

Đánh giá

Issue này chưa được đánh giá.

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.