AllenNeuralDynamics/Rhapso

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An open-source Python toolkit for large-scale fluorescence microscopy data alignment and fusion.

Étoiles: 9
Forks: 3
Issues débutants ouvertes: 0
Issues indexées: 17

Langage dominant: Python
Licence: MIT
Dernier push GitHub: 29/7/2026
Dernière indexation: 13/9/2026
Guide de contribution: Aucun guide de contribution
Code de conduite: Aucun code de conduite
Labels débutants: Aucun label débutant indexé
Métriques de merge des PR: Aucune PR mergée en 30 j

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17 issues ouvertes indexées

Feature Detection dsxy and dsz downsampling implementation missing for levels outside the existing multiscales Ouverte

AllenNeuralDynamics/Rhapso#151 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 13/9/2026
Integration Tests: Attach working XML files for all XML formats and workflows that are supported by Rhapso Ouverte

AllenNeuralDynamics/Rhapso#163 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 13/9/2026
Refactor multiscale ray integration to the pipeline level so it is agnostic to the distributed environment Ouverte

AllenNeuralDynamics/Rhapso#182 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Implement Multichannel stitching Ouverte

AllenNeuralDynamics/Rhapso#186 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Optimize Split Fusion implementation Ouverte

AllenNeuralDynamics/Rhapso#209 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Implement Phase Correlation based registration Ouverte

AllenNeuralDynamics/Rhapso#232 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 13/9/2026
Handle intensity adjustments in multiscale for downsampled scales Ouverte

AllenNeuralDynamics/Rhapso#233 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Resolve Zarr v3 + fsspec/s3fs async aiohttp sessions unclosed after S3 reads/writes. Ouverte

AllenNeuralDynamics/Rhapso#250 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 13/9/2026
Add matchviz like metrics Ouverte

AllenNeuralDynamics/Rhapso#253 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Test failures in main Ouverte

AllenNeuralDynamics/Rhapso#264 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 13/9/2026
Run Tests workflow is disabled Ouverte

AllenNeuralDynamics/Rhapso#265 · 1 commentaire · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 13/9/2026
Upgrade to python 3.12 for Tiff support Ouverte

AllenNeuralDynamics/Rhapso#275 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 13/9/2026
Update multiscale zarr metadata ordering Ouverte

AllenNeuralDynamics/Rhapso#280 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Add round 2 round registration Ouverte

AllenNeuralDynamics/Rhapso#285 · 0 commentaires · 0 réactions · 0 personnes assignées · Indexée le 13/9/2026
Add compression params for fusion and multiscale Ouverte

AllenNeuralDynamics/Rhapso#289 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Add intensity-based candidate matching and RANSAC over full point set for R2R Ouverte

AllenNeuralDynamics/Rhapso#292 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026
Add r2r visualization metrics for TPS displacement field solving Ouverte

AllenNeuralDynamics/Rhapso#293 · 0 commentaires · 0 réactions · 1 personne assignée · Indexée le 13/9/2026

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