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Abierto Todos

465 issues abiertos indexados

TBD: Display result images from Prediction UI for on-screen image Abierto

medium priority UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#276 · 1 comentario · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
UX: Test if models are platform dependent Abierto

AllenCell/allencell-segmenter-ml#277 · 2 comentarios · 0 reacciones · 2 asignados · Indexado el 13/9/2026
Remove Channel Selection from Training & Curation UI for V1 Abierto

UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#278 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Model Selection: Show/Hide tab modules depends on the user's selection Abierto

🚨 high priority🚨 UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#279 · 1 comentario · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Curation UI: add a warning if user closes the plugin Abierto

medium priority UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#280 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Curation: generate test and validation csv Abierto

🚨 high priority🚨 needs clarification

AllenCell/allencell-segmenter-ml#281 · 1 comentario · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Training UI: warning message for CSV input Abierto

needs prioritization UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#282 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Catch-all notes only Abierto

AllenCell/allencell-segmenter-ml#284 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Thao share training dataset w Brian Abierto

AllenCell/allencell-segmenter-ml#285 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Main screen: update disabled/hidden tabs state if a model has not been selected Abierto

🚨 high priority🚨 UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#286 · 0 comentarios · 0 reacciones · 2 asignados · Indexado el 13/9/2026
Training requires filters override Abierto

🚨 high priority🚨

AllenCell/allencell-segmenter-ml#289 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Set num workers based on users # of available cores on cpu Abierto

medium priority

AllenCell/allencell-segmenter-ml#290 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Curation record list changed directly in model state Abierto

low priority refactor

AllenCell/allencell-segmenter-ml#295 · 1 comentario · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
V2 _ Change popup modal for home directory to main screen Abierto

UI/UX

AllenCell/allencell-segmenter-ml#297 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Error reporting from training thread Abierto

🚨 high priority🚨 refactor

AllenCell/allencell-segmenter-ml#305 · 2 comentarios · 0 reacciones · 2 asignados · Indexado el 13/9/2026
Training/Prediction Demo Abierto

AllenCell/allencell-segmenter-ml#309 · 2 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Suggest predefined patch sizes Abierto

AllenCell/allencell-segmenter-ml#312 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Only enable next button when current is also finished Abierto

AllenCell/allencell-segmenter-ml#314 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Refactor training: check user inputs right after train_btn pressed Abierto

low priority refactor

AllenCell/allencell-segmenter-ml#315 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Viewer DS optimization Abierto

AllenCell/allencell-segmenter-ml#316 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
View mapping in curation widget Abierto

AllenCell/allencell-segmenter-ml#319 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Make curation service testable Abierto

AllenCell/allencell-segmenter-ml#320 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Investigate radio button behavior and best practices Abierto

AllenCell/allencell-segmenter-ml#321 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
User defined Patch Sizes Abierto

🚨 high priority🚨

AllenCell/allencell-segmenter-ml#322 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Viewer image naming utils class Abierto

low priority

AllenCell/allencell-segmenter-ml#323 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Change training to use NapariThreadTaskExecutor instead of ChannelExtractionThread. Abierto

low priority refactor

AllenCell/allencell-segmenter-ml#331 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
[training] Remove spatial dims selection. Display to user and update UI when we know the spatial dims of their dataset Abierto

low priority

AllenCell/allencell-segmenter-ml#333 · 0 comentarios · 0 reacciones · 2 asignados · Indexado el 13/9/2026
(Tentative) Deprecate image loader Abierto

refactor

AllenCell/allencell-segmenter-ml#335 · 2 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Finish input view tests Abierto

AllenCell/allencell-segmenter-ml#338 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Create a way for the user to change their home directory Abierto

low priority

AllenCell/allencell-segmenter-ml#341 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
General: what happen after a crash? Abierto

AllenCell/allencell-segmenter-ml#345 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Main screen: what happens if a user accidentally names their new model the same name as an existing one? Abierto

AllenCell/allencell-segmenter-ml#346 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Set up PyPI trusted publisher Abierto

🚨 high priority🚨

AllenCell/allencell-segmenter-ml#362 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
[curation] [multi-channel support] Only load selected channels during curation image loading Abierto

needs prioritization

AllenCell/allencell-segmenter-ml#365 · 1 comentario · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
All segmentations need to be dispayed as label layer Abierto

needs prioritization

AllenCell/allencell-segmenter-ml#366 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
[1.1]create function to copy state dict for model weights Abierto

AllenCell/allencell-segmenter-ml#367 · 1 comentario · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
[1.1] give user option to select an existing model to pull weights from Abierto

AllenCell/allencell-segmenter-ml#368 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
[1.2] test megaseg and models trained on other systems Abierto

AllenCell/allencell-segmenter-ml#369 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
[1.2] set up s3 bucket to host megaseg Abierto

AllenCell/allencell-segmenter-ml#370 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
prediction channel selection fix Abierto

🚨 high priority🚨

AllenCell/allencell-segmenter-ml#371 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Multi-channel segmentations Abierto

🚨 high priority🚨

AllenCell/allencell-segmenter-ml#374 · 2 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Display progress during first epoch Abierto

🚨 high priority🚨

AllenCell/allencell-segmenter-ml#379 · 1 comentario · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Display loss metrics during training Abierto

medium priority

AllenCell/allencell-segmenter-ml#380 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Enforce no timeseries images for curation/training/prediction Abierto

🚨 high priority🚨

AllenCell/allencell-segmenter-ml#381 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Allow timeseries via config Abierto

needs prioritization

AllenCell/allencell-segmenter-ml#382 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
disable save csv button initially Abierto

AllenCell/allencell-segmenter-ml#383 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Curation config / channel selection persistence Abierto

medium priority

AllenCell/allencell-segmenter-ml#386 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
General refactor to align with curation Abierto

low priority refactor

AllenCell/allencell-segmenter-ml#389 · 0 comentarios · 0 reacciones · 0 asignados · Indexado el 13/9/2026
Lint for type hints Abierto

low priority

AllenCell/allencell-segmenter-ml#390 · 2 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026
Prediction inputs need to be directories only Abierto

bug

AllenCell/allencell-segmenter-ml#394 · 0 comentarios · 0 reacciones · 1 asignado · Indexado el 13/9/2026

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